细菌分类

细菌分类 生物分类表 生物分类总表 生物病毒分类表 古菌分类表 细菌分类表 原生生物分类表 藻类分类表 (NCBI) 真菌分类表 植物分类表 植物分类表 (NCBI) APG I、II、III 克朗奎斯特分类 动物分类表 软体动物分类表 环节动物分类表 昆虫分类表 鱼类分类表 两栖动物分类表 爬行动物分类表 鸟类传统分类系统 鸟类DNA分类系统 鹦形目分类表 哺乳动物分类表 翼手目分类表 ​ 1 酸杆菌门(Acidobacteria) o​ 1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria) o​ 1.2 全噬菌纲(Holophagae) ​ 2 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌） o​ 2.1 放线菌纲(Actinobacteria) ​ 3 产水菌门(Aquificae) o​ 3.1 产水菌纲(Aquificae) ​ 4 拟杆菌门(Bacteroidetes) o​ 4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes) o​ 4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria) o​ 4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria) o​ 4.4 纲未定 ​ 5 衣原体门(Chlamydiae) o​ 5.1 衣原体纲(Chlamydiae) ​ 6 绿菌门(Chlorobi) o​ 6.1 绿菌纲(Chlorobia) ​ 7 绿弯菌门(Chloroflexi) o​ 7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae) o​ 7.2 暖绳菌纲(Caldilineae) o​ 7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi) ​ 8 产金菌门(Chrysiogenetes) o​ 8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes) ​ 9 蓝藻门(Cyanobacteria) o​ 9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria) ​ 10 脱铁杆菌门(Deferribacteres) o​ 10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres) ​ 11 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) o​ 11.1 异常球菌纲(Deinococci) ​ 12 网团菌门(Dictyoglomi) o​ 12.1 网团菌纲(Dictyoglomi) ​ 13 纤维杆菌门(Fibrobacteres) o​ 13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres) ​ 14 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌） o​ 14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli) o​ 14.2 梭菌纲(Clostridia) o​ 14.3 热石杆菌纲(Thermolithobacteria) ​ 15 梭杆菌门(Fusobacteria) o​ 15.1 梭杆菌纲(Fusobacteria) ​ 16 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes) o​ 16.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes) ​ 17 黏胶球形菌门(Lentisphaerae) o​ 17.1 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae) ​ 18 硝化螺旋菌门(Nitrospirae) o​ 18.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira) ​ 19 浮霉菌门(Planctomycetes) o​ 19.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia) ​ 20 海绵杆菌门(Poribacteria)* ​ 21 变形菌门(Proteobacteria) o​ 21.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria) o​ 21.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria) o​ 21.3 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria) o​ 21.4 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria) o​ 21.5 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria) ​ 22 螺旋体门(Spirochaetes) o​ 22.1 螺旋体纲(Spirochaetes) ​ 23 柔膜菌门(Tenericutes) o​ 23.1 柔膜菌纲(Mollicutes) ​ 24 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria) o​ 24.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria) ​ 25 热微菌门(Thermomicrobia) o​ 25.1 热微菌纲(Thermomicrobia) ​ 26 热袍菌门(Thermotogae) o​ 26.1 热袍菌纲(Thermotogae) ​ 27 疣微菌门(Verrucomicrobia) o​ 27.1 丰祐菌纲(Opitutae) o​ 27.2 疣微菌纲(Verrucomicrobiae) ​ 28 门未定 o​ 28.1 纤线杆菌纲(Ktedonobacteria) 酸杆菌门(Acidobacteria) 酸杆菌纲(Acidobacteria) 1.​ 酸杆菌目(Acidobacteriales) 1.​ 酸杆菌科(Acidobacteriaceae) 1.​ 酸杆菌属(Acidobacterium) 2.​ (Edaphobacter) 3.​ (Terriglobus) 全噬菌纲(Holophagae) 1.​ 石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales) 1.​ 石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae) 1.​ 石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter) 2.​ 全噬菌目(Holophagales) 1.​ 全噬菌科(Holophagaceae) 1.​ 地发菌属(Geothrix) 2.​ 全噬菌属(Holophaga) 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌） 放线菌纲(Actinobacteria) 1.​ 酸微菌亚纲(Acidimicrobidae) 1.​ 酸微菌目(Acidimicrobiales) 1.​ 酸微菌亚目(Acidimicrobineae) 1.​ 酸微菌科(Acidimicrobiaceae) 1.​ 酸微菌属(Acidimicrobium) 2.​ (Iamiaceae) 1.​ (Iamia) 2.​ 放线菌亚纲(Actinobacteridae) 1.​ 放线菌目(Actinomycetales) 1.​ 放线菌亚目(Actinomycineae) 1.​ 放线菌科(Actinomycetaceae) 1.​ 放线棒菌属(Actinobaculum) 2.​ 放线菌属(Actinomyces) 3.​ 隐秘杆菌属(Arcanobacterium) 4.​ (Falcivibrio) 5.​ 动弯杆菌属(Mobiluncus) 6.​ (Varibaculum) 2.​ (Actinopolysporineae) 1.​ (Actinopolysporaceae) 1.​ (Actinopolyspora) 3.​ (Catenulisporineae) 1.​ (Actinospicaceae) 1.​ (Actinospica) 2.​ (Catenulisporaceae) 1.​ (Catenulispora) 4.​ 棒杆菌亚目(Corynebacterineae) 1.​ 棒杆菌科(Corynebacteriaceae) 1.​ (Bacterionema) 2.​ (Caseobacter) 3.​ 棒杆菌属(Corynebacterium) 4.​ (Turicella) 2.​ 迪茨氏菌科(Dietziaceae) 1.​ 迪茨氏菌属(Dietzia) 3.​ 分枝杆菌科(Mycobacteriaceae) 1.​ 分枝杆菌属(Mycobacterium) （含结核杆菌） 4.​ 诺卡氏菌科(Nocardiaceae) 1.​ 戈登氏菌属(Gordonia) 2.​ (Micropolyspora) 3.​ (Millisia) 4.​ 诺卡氏菌属(Nocardia) 5.​ 红球菌属(Rhodococcus) 6.​ 斯科曼氏菌属(Skermania) 7.​ (Williamsia) 8.​ (Smaragdicoccus) 5.​ (Segniliparaceae) 1.​ (Segniliparus) 6.​ 束村氏菌科(Tsukamurellaceae) 1.​ 束村氏菌属(Tsukamurella) 5.​ 弗兰克氏菌亚目(Frankineae) 1.​ 酸热菌科(Acidothermaceae) 1.​ 酸热菌属(Acidothermus) 2.​ 弗兰克氏菌科(Frankiaceae) 1.​ 弗兰克氏菌属(Frankia) 3.​ 地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae) 1.​ 芽球菌属(Blastococcus) 2.​ 地嗜皮菌属(Geodermatophilus) 3.​ (Modestobacter) 4.​ (Kineosporiaceae) 1.​ (Cryptosporangium) 2.​ (Kineococcus) 3.​ (Kineosporia) 5.​ (Nakamurellaceae) 1.​ (Humicoccus) 2.​ (Nakamurella) 3.​ (Quadrisphaera) 6.​ 孢鱼菌科(Sporichthyaceae) 1.​ 孢鱼菌属(Sporichthya) 6.​ 糖霉菌亚目(Glycomycineae) 1.​ 糖霉菌科(Glycomycetaceae) 1.​ 糖霉菌属(Glycomyces) 2.​ (Stackerbrandtia) 7.​ 微球菌亚目(Micrococcineae) 1.​ 获山氏菌科(Beutenbergiaceae) 1.​ 获山氏菌属(Beutenbergia) 2.​ 乔治菌属(Georgenia) 3.​ 萨勒河菌属(Salana) 2.​ 博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae) 1.​ 博戈里亚湖菌属(Bogoriella) 3.​ 短杆菌科(Brevibacteriaceae) 1.​ 短杆菌属(Brevibacterium) 4.​ 纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae) 1.​ 纤维素单胞菌属(Cellulomonas) 2.​ 厄氏菌属(Oerskovia) 3.​ (Tropheryma) 5.​ (Dermabacteraceae) 1.​ (Brachybacterium) 2.​ (Dermabacter) 6.​ (Dermacoccaceae) 1.​ (Demetria) 2.​ (Dermacoccus) 3.​ (Kytococcus) 7.​ (Dermatophilaceae) 1.​ (Dermatophilus) 2.​ (Kineosphaera) 8.​ (Intrasporangiaceae) 1.​ (Arsenicicoccus) 2.​ (Humihabitans) 3.​ (Intrasporangium) 4.​ (Janibacter) 5.​ (Knoellia) 6.​ (Kribbia) 7.​ (Lapillicoccus) 8.​ (Ornithinicoccus) 9.​ (Ornithinimicrobium) 10.​ (Oryzihumus) 11.​ (Serinicoccus) 12.​ (Terrabacter) 13.​ (Terracoccus) 14.​ (Tetrasphaera) 9.​ (Jonesiaceae) 1.​ (Jonesia) 10.​ (Microbacteriaceae) 1.​ (Agreia) 2.​ (Agrococcus) 3.​ (Agromyces) 4.​ (Aureobacterium) 5.​ (Clavibacter) 6.​ (Cryobacterium) 7.​ (Curtobacterium) 8.​ (Frigoribacterium) 9.​ (Frondicola) 10.​ (Gulosibacter) 11.​ (Labedella) 12.​ (Leifsonia) 13.​ (Leucobacter) 14.​ (Microbacterium) 15.​ (Microcella) 16.​ (Mycetocola) 17.​ (Okibacterium) 18.​ (Plantibacter) 19.​ (Pseudoclavibacter) 20.​ (Rathayibacter) 21.​ (Rhodoglobus) 22.​ (Salinibacterium) 23.​ (Subtercola) 24.​ (Yonghaparkia) 25.​ (Zimmermannella) 11.​ 微球菌科(Micrococcaceae) 1.​ (Acaricomes) 2.​ 节杆菌属(Arthrobacter) 3.​ (Citricoccus) 4.​ (Kocuria) 5.​ 微球菌属(Micrococcus) 6.​ (Nesterenkonia) 7.​ (Renibacterium) 8.​ 罗氏菌属(Rothia) 9.​ 口腔球菌属(Stomatococcus) 10.​ 刘志恒菌属(Zhihengliuella) 12.​ (Promicromonosporaceae) 1.​ (Cellulosimicrobium) 2.​ (Isoptericola) 3.​ (Myceligenerans) 4.​ (Promicromonospora) 5.​ (Xylanibacterium) 6.​ (Xylanimonas) 13.​ (Rarobacteraceae) 1.​ (Rarobacter) 14.​ (Sanguibacteraceae) 1.​ 血杆菌属(Sanguibacter) 15.​ (Yaniaceae) 1.​ (Yania) 16.​ 科未定 1.​ (Actinotalea) 2.​ (Demequina) 3.​ (Phycicoccus) 4.​ (Ruania) 8.​ 微单孢菌亚目(Micromonosporineae) 1.​ 微单孢菌科(Micromonosporaceae) 1.​ (Actinocatenispora) 2.​ (Actinoplanes) 3.​ (Amorphosporangium) 4.​ (Ampullariella) 5.​ (Asanoa) 6.​ (Catellatospora) 7.​ (Catenuloplanes) 8.​ (Couchiolanes) 9.​ (Dactylosporangium) 10.​ (Krasilnikovia) 11.​ (Longispora) 12.​ (Luedemannella) 13.​ 微单孢菌属(Micromonospora) 14.​ (Pilimelia) 15.​ (Planopolyspora) 16.​ (Polymorphospora) 17.​ (Salinispora) 18.​ (Spirilliplanes) 19.​ (Verrucosispora) 20.​ (Virgisporangium) 9.​ 丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae) 1.​ (Nocardioidaceae) 1.​ (Actinopolymorpha) 2.​ (Aeromicrobium) 3.​ (Friedmanniella) 4.​ (Hongia) 5.​ (Kribbella) 6.​ (Marmoricola) 7.​ (Micropruina) 8.​ (Nocardioides) 9.​ (Pimelobacter) 10.​ (Propionicicella) 11.​ (Propionicimonas) 2.​ 丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae) 1.​ 河口微菌属(Aestuariimicrobium) 2.​ (Arachnia) 3.​ (Brooklawnia) 4.​ (Granulicoccus) 5.​ 江氏菌属(Jiangella) 6.​ (Luteococcus) 7.​ (Microlunatus) 8.​ 丙酸杆菌属(Propionibacterium) 9.​ (Propioniferax) 10.​ (Propionimicrobium) 11.​ (Tessaracocccus) 10.​ (Pseudonocardineae) 1.​ (Actinosynnemataceae) 1.​ (Actinokineospora) 2.​ (Actinosynnema) 3.​ (Lechevalieria) 4.​ (Lentzea) 5.​ (Saccharothrix) 6.​ (Umezawaea) 2.​ (Pseudonocardiaceae) 1.​ (Actinoalloteichus) 2.​ (Actinobispora) 3.​ (Amycolata) 4.​ (Amycolatopsis) 5.​ (Crossiella) 6.​ (Faenia) 7.​ (Goodfellowia) 8.​ (Kibdelosporangium) 9.​ (Kutzneria) 10.​ (Prauserella) 11.​ (Pseudoamycolata) 12.​ (Pseudonocardia) 13.​ (Saccharomonospora) 14.​ (Saccharopolyspora) 15.​ (Streptoalloteichus) 16.​ (Thermobispora) 11.​ (Thermocrispum) 12.​ 链霉菌亚目(Streptomycineae) 1.​ 链霉菌科(Sterptomycetaceae) 1.​ (Actinopycnidium) 2.​ (Actinosporangium) 3.​ (Chainia) 4.​ (Elytrosporangium) 5.​ 北里菌属(Kitasatoa) 6.​ 北里孢菌属(Kitasatospora) 7.​ (Microellobosporia) 8.​ (Streptacidiphilus) 9.​ 链霉菌属(Streptomyces) 10.​ (Streptoverticillium) 13.​ (Streptosporangineae) 1.​ (Nocardiopsaceae) 1.​ (Nocardiopsis) 2.​ (Streptomonospora) 3.​ (Thermobifida) 2.​ (Streptosporangiaceae) 1.​ (Acrocarpospora) 2.​ (Herbidospora) 3.​ (Microbispora) 4.​ (Microtetraspora) 5.​ (Nonomuraea) 6.​ (Planobispora) 7.​ (Planomonospora) 8.​ (Planotetraspora) 9.​ (Sphaerisporangium) 10.​ (Streptosporangium) 11.​ (Thermopolyspora) 3.​ (Thermomonosporaceae) 1.​ 珊瑚状放线菌属(Actinocorallia) 2.​ (Actinomadura) 3.​ (Excellospora) 4.​ (Spirillospora) 5.​ (Thermomonospora) 2.​ 双歧杆菌目(Bifidobacteriales) 1.​ 双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae) 1.​ (Aeriscardovia) 2.​ (Alloscardovia) 3.​ 双歧杆菌属(Bifidobacterium) 4.​ (Gardnerella) 5.​ (Metascardovia) 6.​ (Parascardovia) 7.​ (Scardovia) 2.​ 科未定 3.​ (Coriobacteridae) 1.​ (Coriobacteriales) 1.​ (Coriobacterineae) 1.​ (Coriobacteriaceae) 1.​ 奇异菌属(Atopobium) 2.​ (Collinsella) 3.​ (Coriobacterium) 4.​ (Cryptobacterium) 5.​ (Denitrobacterium) 6.​ (Eggerthella) 7.​ (Olsenella) 8.​ (Slackia) 4.​ 红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae) 1.​ 红色杆菌目(Rubrobacterales) 1.​ 红色杆菌亚目(Rubrobacterineae) 1.​ (Conexibacteraceae) 1.​ (Conexibacter) 2.​ (Patulibacteraceae) 1.​ (Patulibacter) 3.​ 红色杆菌科(Rubrobacteraceae) 1.​ 红色杆菌属(Rubrobacter) 4.​ (Solirubrobacteraceae) 1.​ (Solirubrobacter) 5.​ (Thermoleophilaceae) 1.​ (Thermoleophilum) 5.​ 球形杆菌亚纲(Sphaerobacteridae) 1.​ 球形杆菌目(Sphaerobacterales) 1.​ 球形杆菌亚目(Sphaerobacterineae) 1.​ 球形杆菌科(Sphaerobacteraceae) 1.​ 球形杆菌属(Sphaerobacter) 产水菌门(Aquificae) 产水菌纲(Aquificae) 1.​ 产水菌目(Aquificales) 1.​ 产水菌科(Aquificaceae) 1.​ 产水菌属(Aquifex) 2.​ (Calderobacterium) 3.​ (Hydrogenivirga) 4.​ (Hydrogenobacter) 5.​ (Hydrogenobaculum) 6.​ (Thermocrinis) 2.​ 除硫杆菌科(Desulfurobacteriaceae) 1.​ (Balnearium) 2.​ 除硫杆菌属(Desulfurobacterium) 3.​ 热弧菌属(Thermovibrio) 3.​ (Hydrogenothermaceae) 1.​ (Hydrogenothermus) 2.​ (Persephonella) 3.​ (Sulfurihydrogenibium) 拟杆菌门(Bacteroidetes) 拟杆菌纲(Bacteroidetes) 1.​ 拟杆菌目(Bacteroidales) 1.​ 拟杆菌科(Bacteroidaceae) 1.​ (Acetomicrobium) 2.​ (Anaerophaga) 3.​ (Anaerorhabdus) 4.​ 拟杆菌属(Bacteroides) 5.​ (Pontibacter) 2.​ 紫单胞菌科(Porphyromonadaceae) 1.​ (Barnesiella) 2.​ (Capsularis) 3.​ (Dysgonomonas) 4.​ (Hallella) 5.​ (Odoribacter) 6.​ (Oribaculum) 7.​ (Paludibacter) 8.​ (Parabacteroides) 9.​ 紫单胞菌属(Porphyromonas) （多译作“卟啉单胞菌”，但porphyro-应来源于希腊语“紫色”） 10.​ (Proteiniphilum) 11.​ (Tannerella) 12.​ (Xylanibacter) 3.​ 普雷沃氏菌科(Prevotellaceae) 1.​ 普雷沃氏菌属(Prevotella) （或译作“普氏菌”） 4.​ 理研菌科(Rikenellaceae) 1.​ (Alistipes) 2.​ (Alkaliflexus) 3.​ (Marinilabilia) 4.​ (Petrimonas) 5.​ 理研菌属(Rikenella) （注：Riken是日语“理化学研究所”简称） 5.​ 科未定 1.​ (Acetofilamentum) 2.​ (Acetothermus) 黄杆菌纲(Flavobacteria) 1.​ 黄杆菌目(Flavobacteriales) 1.​ 蟑螂杆状体科(Blattabacteriaceae) 1.​ 蟑螂杆状体属(Blattabacterium) 2.​ (Cryomorphaceae) 1.​ (Algoriphagus) 2.​ (Brumimicrobium) 3.​ (Crocinitomix) 4.​ (Cryomorpha) 5.​ (Fluviicola) 6.​ 李时珍菌属(Lishizhenia) 7.​ (Owenweeksia) 3.​ 黄杆菌科(Flavobacteriaceae) 1.​ (Actibacter) 2.​ (Aequorivita) 3.​ (Algibacter) 4.​ (Aquimarina) 5.​ (Arenibacter) 6.​ 伯杰菌属(Bergeyella) 7.​ (Bizionia) 8.​ 碳酸噬胞菌属(Capnocytophaga) （注：多译作“二氧化碳噬纤维菌属”） 9.​ 噬纤维素菌属(Cellulophaga) 10.​ 金黄杆菌属(Chryseobacterium) 11.​ (Cloacibacterium) 12.​ (Coenonia) 13.​ (Costertonia) 14.​ (Croceibacter) 15.​ 独岛菌属(Dokdonia) 16.​ 东海菌属(Donghaeana) 17.​ (Elizabethkingia) 18.​ (Empedobacter) 19.​ (Epilithonimonas) 20.​ (Flaviramulus) 21.​ 黄杆菌属(Flavobacterium) 22.​ (Formosa) 23.​ 泥滩杆菌属(Gaetbulibacter) 24.​ 泥滩微菌属(Gaetbulimicrobium) 25.​ (Galbibacter) 26.​ (Gelidibacter) 27.​ (Gillisia) 28.​ (Gilvibacter) 29.​ 革兰菌属(Gramella) 30.​ (Kaistella) 31.​ (Kordia) 32.​ (Krokinobacter) 33.​ (Lacinutrix) 34.​ 列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella) 35.​ (Lutibacter) 36.​ (Maribacter) 37.​ (Mariniflexile) 38.​ (Marixanthomonas) 39.​ (Mesonia) 40.​ (Muricauda) 41.​ (Myroides) 42.​ (Nonlabens) 43.​ (Olleya) 44.​ (Ornithobacterium) 45.​ (Persicivirga) 46.​ (Pibocella) 47.​ 极地杆菌属(Polaribacter) 48.​ 冷弯菌属(Psychroflexus) 49.​ (Psychroserpens) 50.​ (Riemerella) 51.​ (Robiginitalea) 52.​ (Salegentibacter) 53.​ (Sandarakinotalea) 54.​ (Sediminibacter) 55.​ (Sediminicola) 56.​ 世宗菌属(Sejongia) 57.​ (Stanierella) 58.​ (Stenothermobacter) 59.​ (Subsaxibacter) 60.​ (Subsaximicrobium) 61.​ (Tamlana) 62.​ (Tenacibaculum) 63.​ (Ulvibacter) 64.​ (Vitellibacter) 65.​ (Wautersiella) 66.​ (Weeksella) 67.​ (Winogradskyella) 68.​ 丽水菌属(Yeosuana) 69.​ (Zeaxanthinibacter) 70.​ 周氏菌属(Zhouia) 71.​ (Zobellia) 72.​ 王祖农菌属(Zunongwangia) 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria) 1.​ 鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales) 1.​ 泉发菌科(Crenotrichaceae) 1.​ (Balneola) 2.​ (Chitinophaga) 3.​ 泉发菌属(Crenothrix) 4.​ (Rhodothermus) 5.​ (Salinibacter) 6.​ (Terrimonas) 7.​ (Toxothrix) 2.​ (Flammeovirgaceae) 1.​ (Flammeovirga) 2.​ (Flexithrix) 3.​ (Perexilibacter) 4.​ (Persicobacter) 5.​ (Rapidithrix) 6.​ (Sediminitomix) 7.​ (Thermonema) 3.​ 屈挠杆菌科(Flexibacteraceae) 1.​ (Adhaeribacter) 2.​ (Aquiflexum) 3.​ (Arcicella) 4.​ (Belliella) 5.​ (Chimaereicella) 6.​ (Cyclobacterium) 7.​ 噬胞菌属(Cytophaga) （注：目前多称此属为“噬纤维菌属”，此处依拉丁文） 8.​ (Dyadobacter) 9.​ (Echinicola) 10.​ (Effluviibacter) 11.​ (Emticicia) 12.​ (Fabibacter) 13.​ (Flectobacillus) 14.​ 屈挠杆菌属(Flexibacter) 15.​ (Hongiella) 16.​ (Hymenobacter) 17.​ (Larkinella) 18.​ (Leadbetterella) 19.​ (Marinicola) 20.​ (Meniscus) 21.​ (Microscilla) 22.​ (Niastella) 23.​ (Persicitalea) 24.​ (Reichenbachiella) 25.​ (Rhodonellum) 26.​ (Roseivirga) 27.​ (Runella) 28.​ (Spirosoma) 29.​ 生孢噬胞菌属(Sporocytophaga) 4.​ 腐螺旋菌科(Saprospiraceae) 1.​ (Aureispira) 2.​ (Haliscomenobacter) 3.​ (Lewinella) 4.​ 腐螺旋菌属(Saprospira) 5.​ 鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae) 1.​ (Mucilaginibacter) 2.​ (Olivibacter) 3.​ (Parapedobacter) 4.​ (Pedobacter) 5.​ (Pseudosphingobacterium) 6.​ 鞘脂杆菌属(Sphingobacterium) 6.​ 科未定 1.​ (Niabella) 纲未定 1.​ (Flavisolibacter) 2.​ (Fulvivirga) 3.​ (Prolixibacter) 4.​ (Segetibacter) 衣原体门(Chlamydiae) 衣原体纲(Chlamydiae) 1.​ 衣原体目(Chlamydiales) 1.​ 衣原体科(Chlamydiaceae) 1.​ 衣原体属(Chlamydia) 2.​ 嗜衣体属(Chlamydophila) 2.​ 副衣原体属(Parachlamydiaceae) 1.​ 新衣原体属(Neochlamydia) 2.​ 副衣原体属(Parachlamydia) 3.​ 芯卡体科(Simkaniaceae) 1.​ 芯卡体属(Simkania) （注：人名缩写简称，此处用音译） 2.​ 棍衣原体属(Rhabdochlamydia)* 4.​ 华诊体科(Waddliaceae) 1.​ 华诊体属(Waddlia) （注：WADDL为“华盛顿动物病诊断实验室”缩写） 绿菌门(Chlorobi) 绿菌纲(Chlorobia) 1.​ 绿菌目(Chlorobiales) 1.​ 绿菌科(Chlorobiaceae) 1.​ 臂绿菌属(Ancalochloris) 2.​ 绿棒菌属(Chlorobaculum) 3.​ 绿菌属(Chlorobium) 4.​ 绿爬菌属(Chloroherpeton) 5.​ 暗网菌属(Pelodictyon) 6.​ 突柄绿菌属(Prosthecochloris) 绿弯菌门(Chloroflexi) 厌氧绳菌纲(Anaerolineae) 1.​ 厌氧绳菌目(Anaerolineales) 1.​ 厌氧绳菌科(Anaerolineaceae) 1.​ 厌氧绳菌属(Anaerolinea) 2.​ (Bellilinea) 3.​ 纤绳菌属(Leptolinea) 4.​ (Levilinea) 5.​ 长绳菌属(Longilinea) 暖绳菌纲(Caldilineae) 1.​ 暖绳菌目(Caldilineales) 1.​ 暖绳菌科(Caldilineaceae) 1.​ 暖绳菌属(Caldilinea) 绿弯菌纲(Chloroflexi) 1.​ 绿弯菌目(Chloroflexales) 1.​ 绿弯菌科(Chloroflexaceae) 1.​ 绿弯菌属(Chloroflexus) 2.​ 绿线菌属(Chloronema) 3.​ 太阳发菌属(Heliothrix) 4.​ 玫瑰弯菌属(Roseiflexus) 2.​ 颤绿菌科(Oscillochloridaceae) 1.​ 颤绿菌属(Oscillochloris) 2.​ 爬管菌目(Herpetosiphonales) 1.​ 爬管菌科(Herpetosiphonaceae) 1.​ 爬管菌属(Herpetosiphon) 产金菌门(Chrysiogenetes) 产金菌纲(Chrysiogenetes) 1.​ 产金菌目(Chrysiogenales) 1.​ 产金菌科(Chrysiogenaceae) 1.​ 产金菌属(Chrysiogenes) 蓝藻门(Cyanobacteria) 蓝藻纲(Cyanobacteria) 1.​ 第一目（色球藻目(Chroococcales)）@ 1.​ 第一科@ 1.​ 管孢藻属(Chamaesiphon)@ 2.​ 色球藻属(Chroococcus)@ 3.​ (Cyanobacterium)@ 4.​ (Cyanobium)@ 5.​ (Cyanothece)@ 6.​ 蓝纤维藻属(Dactylococcopsis)@ 7.​ (Gloeobacter)@ 8.​ 黏球藻属(Gloeocapsa)@ 9.​ 黏杆藻属(Gloeothece)@ 10.​ 微囊藻属(Microcystis)@ 11.​ 原绿球藻属(Prochlorococcus)@ 12.​ 原绿藻属(Prochloron)@ 13.​ 聚球藻属(Synechococcus)@ 14.​ 集胞藻属(Synechocystis)@ 2.​ 第二目（宽球藻目(Pleurocapsales)）@ 1.​ 第一科@ 1.​ (Cyanocystis)@ 2.​ (Dermocarpella)@ 3.​ (Stanieria)@ 4.​ 异球藻属(Xenococcus)@ 2.​ 第二科@ 1.​ 拟色球藻属(Chroococcidiopsis)@ 2.​ 黏囊藻属(Myxosarcina)@ 3.​ 宽球藻属(Pleurocapsa)@ 3.​ 第三目（颤藻目(Oscillatoriales)）@ 1.​ 第一科@ 1.​ 节螺藻属(Arthrospira)@ （包含商业化螺旋藻） 2.​ (Borzia)@ 3.​ (Crinalium)@ 4.​ (Geitlerinema)@ 5.​ 盐螺旋藻属(Halospirulina) 6.​ (Leptolyngbya)@ 7.​ (Limnothrix)@ 8.​ 鞘丝藻属(Lyngbya)@ 9.​ 微鞘藻属(Microcoleus)@ 10.​ 颤藻属(Oscillatoria)@ 11.​ (Planktothrix)@ 12.​ 原绿发藻属(Prochlorothrix)@ 13.​ (Pseudanabaena)@ 14.​ 螺旋藻属(Spirulina)@ 15.​ (Starria)@ 16.​ 束藻属(Symploca)@ 17.​ 束毛藻属(Trichodesmium) 18.​ (Tychonema)@ 4.​ 第四目（念珠藻目(Nostocales)）@ 1.​ 第一科@ 1.​ 鱼腥藻属(Anabaena)@ 2.​ 项圈藻属(Anabaenopsis)@ 3.​ 束丝藻属(Aphanizomenon)@ 4.​ (Cyanospira)@ 5.​ (Cylindrospermopsis)@ 6.​ 筒孢藻属(Cylindrospermum)@ 7.​ 节球藻属(Nodularia)@ 8.​ 念珠藻属(Nostoc)@ 9.​ 伪枝藻属(Scytonema)@ 2.​ 第二科@ 1.​ 眉藻属(Calothrix)@ 2.​ 胶须藻属(Rivularia)@ 3.​ 单歧藻属(Tolypothrix)@ 5.​ 第五目（真枝藻目(Stigonematales)）@ 1.​ 第一科@ 1.​ (Chlorogloeopsis)@ 2.​ 费氏藻属(Fischerella)@ 3.​ (Geitleria)@ 4.​ (Iyengariella)@ 5.​ 拟念珠藻属(Nostochopsis)@ 6.​ 真枝藻属(Stigonema)@ 脱铁杆菌门(Deferribacteres) 脱铁杆菌纲(Deferribacteres) 1.​ 脱铁杆菌目(Deferribacterales) 1.​ 脱铁杆菌科(Deferribacteraceae) 1.​ 脱铁杆菌属(Deferribacter) 2.​ (Denitrovibrio) 3.​ (Flexistipes) 4.​ 地弧菌属(Geovibrio) 5.​ (Mucispirillum) 2.​ 科未定 1.​ 暖发菌属(Caldithrix) 2.​ (Synergistes) 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) 异常球菌纲(Deinococci) 1.​ 异常球菌目(Deinococcales) 1.​ 异常球菌科(Deinococcaceae) 1.​ 异常杆菌属(Deinobacter) 2.​ 异常球菌属(Deinococcus) 2.​ 特吕珀菌科(Trueperaceae) 1.​ 特吕珀菌属(Truepera) 2.​ 栖热菌目(Thermales) 1.​ 栖热菌科(Thermaceae) 1.​ 海栖热菌属(Marinithermus) 2.​ 亚栖热菌属(Meiothermus) 3.​ 海洋栖热菌属(Oceanithermus) 4.​ 栖热菌属(Thermus) 5.​ 火山栖热菌属(Vulcanithermus) 网团菌门(Dictyoglomi) 网团菌纲(Dictyoglomi) 1.​ 网团菌目(Dictyoglomales) 1.​ 网团菌科(Dictyoglomaceae) 1.​ 网团菌属(Dictyoglomus) 纤维杆菌门(Fibrobacteres) 纤维杆菌纲(Fibrobacteres) 1.​ 纤维杆菌目(Fibrobacterales) 1.​ 纤维杆菌科(Fibrobacteraceae) 1.​ 纤维杆菌属(Fibrobacter) 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌） 芽孢杆菌纲(Bacilli) 1.​ 芽孢杆菌目(Bacillales) 1.​ (Alicyclobacillaceae) 1.​ (Alicyclobacillus) 2.​ (Pasteuria) 3.​ (Sulfobacillus) 2.​ 芽孢杆菌科(Bacillaceae) 1.​ (Alkalibacillus) 2.​ (Amphibacillus) 3.​ (Anoxybacillus) 4.​ 芽孢杆菌属(Bacillus) 5.​ (Caldalkalibacillus) 6.​ (Cerasibacillus) 7.​ (Exiguobacterium) 8.​ (Filobacillus) 9.​ (Geobacillus) 10.​ (Gracilibacillus) 11.​ (Halalkalibacillus) 12.​ (Halobacillus) 13.​ (Haloactibacillus) 14.​ (Jeotgalibacillus) 15.​ (Lentibacillus) 16.​ (Lysinibacillus) 17.​ (Marinibacillus) 18.​ (Oceanobacillus) 19.​ (Ornithinibacillus) 20.​ (Paraliobacillus) 21.​ (Paucisalibacillus) 22.​ (Pelagibacillus) 23.​ (Piscibacillus) 24.​ (Pontibacillus) 25.​ 糖球菌属(Saccharococcus) 26.​ (Salibacillus) 27.​ (Salimicrobium) 28.​ (Salinibacillus) 29.​ (Salirhabdus) 30.​ (Sasuginibacillus) 31.​ (Tenuibacillus) 32.​ (Terribacillus) 33.​ (Thalassobacillus) 34.​ (Ureibacillus) 35.​ (Virgibacillus) 36.​ (Vulcanibacillus) 3.​ (Caryophanaceae) 1.​ (Caryophanon) 4.​ 李斯特氏菌科(Listeriaceae) 1.​ 环丝菌属(Brochothrix) 2.​ 李斯特氏菌属(Listeria) 5.​ (Paenibacillaceae) 1.​ (Ammoniphilus) 2.​ (Aneurinibacillus) 3.​ (Brevibacillus) 4.​ (Cohnella) 5.​ (Oxalophagus) 6.​ (Paenibacillus) 7.​ (Thermicanus) 8.​ (Thermobacillus) 6.​ (Planococcaceae) 1.​ (Filibacter) 2.​ (Kurthia) 3.​ (Planococcus) 4.​ (Planomicrobium) 5.​ (Sporosarcina) 7.​ 芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae) 1.​ (Marinococcus) 2.​ (Sinococcus) 3.​ 芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus) 4.​ (Tuberibacillus) 8.​ 葡萄球菌科(Staphylococcaceae) 1.​ 孪生菌属(Gemella) 2.​ (Joetgalicoccus) 3.​ (Macrococcus) 4.​ (Salinicoccus) 5.​ 葡萄球菌属(Staphylococcus) 9.​ (Thermoactinomycetaceae) 1.​ (Laceyella) 2.​ (Mechercharimyces) 3.​ (Planifilum) 4.​ (Seinonella) 5.​ (Shimazuella) 6.​ (Thermoactinomyces) 7.​ (Thermoflavimicrobium) 10.​ (Turicibacteraceae) 1.​ (Turicibacter) 11.​ 科未定 1.​ (Pullulanibacillus) 2.​ 乳杆菌目(Lactobacillales) 1.​ 气球菌科(Aerococcaceae) 1.​ (Abiotrophia) 2.​ 气球菌属(Aerococcus) 3.​ (Dolosicoccus) 4.​ (Eremococcus) 5.​ (Facklamia) 6.​ (Globicatella) 7.​ (Ignavigranum) 2.​ 肉杆菌科(Carnobacteriaceae) 1.​ (Agitococcus) 2.​ (Alkalibacterium) 3.​ (Allofustis) 4.​ (Alloiococcus) 5.​ (Atopococcus) 6.​ (Atopostipes) 7.​ 肉杆菌属(Carnobacterium) 8.​ 德库菌属(Desemzia) （DSMZ，德国微生物与细胞保藏中心） 9.​ (Dolosigranulum) 10.​ (Granulicatella) 11.​ (Isobaculum) 12.​ (Lactosphaera) 13.​ (Marinilactibacillus) 14.​ (Trichococcus) 3.​ 肠球菌科(Enterococcaceae) 1.​ (Atopobacter) 2.​ (Catellicoccus) 3.​ 肠球菌属(Enterococcus) 4.​ (Melissococcus) 5.​ (Pilibacter) 6.​ (Tetragenococcus) 7.​ 漫游球菌属(Vagococcus) 4.​ 乳杆菌科(Lactobacillaceae) 1.​ 乳杆菌属(Lactobacillus) 2.​ (Paralactobacillus) 3.​ 片球菌属(Pediococcus) 5.​ 明串珠菌科(Leuconostocaceae) 1.​ 明串珠菌属(Leuconostoc) 2.​ (Oenococcus) 3.​ (Weissella) 6.​ 颤螺旋菌科(Oscillospiraceae) 1.​ 颤杆菌克(Oscillibacter) 2.​ 颤螺旋菌属(Oscillospira) 7.​ 链球菌科(Streptococcaceae) 1.​ 乳球菌属(Lactococcus) 2.​ (Lactovum) 3