云南白族15个常染色体STR基因座的遗传多态性研究.doc

云南白族15个常染色体STR基因座的遗传多态性研究.doc 云南白族15个常染色体STR基因座的遗传多态性研究 短串联重复序列(shorttandemrepeats，STR)由于其在整个人类基因组中高度杂合性和多态性被广泛应用于法医学实践。近年来，常染色体STR基础数据库在个人识别和亲权鉴定方面显示出了强大的优越性，成为国内外研究最常用的技术之一。本研究是第一次对云南怒江白族常染色体的15个基因座进行报道，调查云南怒江白族人群的遗传多态性，为该地区少数民族个体的法医学鉴定提供遗传学数据，同时为法医个人识别和亲权鉴定提供参考，丰富国内DNA数据库。 1与方法 1.1材料 随机采集云南怒江地区124名白族无关个体外周血，且证实三代以内均居住于怒江地区。所有血样均经EDTA抗凝，保存于-20?的环境下。 1.2方法 DNA的提取、扩增及基因分型:采取经典的酚-氯仿有机法对血样进行DNA提取，用美国ABI公司生产的AmpFISTRIdentifierTM试剂盒，复合扩增15个STR基因座(TPOX、D16S539、D3S1358、CSF1PO、D5S818、TH01、vWA、D7S820、D13S317、D8S1179、FGA、D21S11、D18S51、D19S433、D2S1338)及Amelogenin基因，用9700扩增仪(ABI公司)进行扩增，扩增严格按照试剂盒要求进行操作，PRISM3130(ABI公司)遗传分析仪进行毛细管电泳分离，STR片段的分离检测用Analyzer软件(ABI公司)。用GeneMapperIDv3.2Software软件(ABI公司)对所得数据进行分析，得到分型结果。 1.3统计学处理 所有被用于法医个体识别和亲权鉴定的基因频率和法医学参数(包括多态性信息含量(PIC)，非父排除率(PE)，匹配概率(PM)，实际杂合度(H0)和期望杂合度(HE)，累积匹配概率(CMP)，累积非父排除率(CPE)累积个人识别能力(CDP))用Modified-PowerStats软件(ABI公司)计算，用Arlequin3.5软件 (ABI公司)进行Hardy-Weinberg平衡检验。遗传距离通过Dispan计算，得出数据用MEGA4软件做出系统进化树。 2结果 124名怒江白族无关个体D3S1358、TH01、D21S11等15个常染色体STR基因座的基因分布均得到了满意的分型结果，所得15个常染色体STR基因座等位基因和基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律，P均大于0.05.多态信息含量、杂合度、个体识别能力、累积个体识别能力、非父排除率、累积非父排除率.15个常染色体STR基因座中，实际杂合度观察值介于0.1613,0.3871之间，杂合度的期望值介于0.6129,0.8387之间.多态信息含量介于0.5112~0.8504之间.个体识别能力介于0.7448,0.9603之间，15个常染色体STR基因座的累积个人识别能力达到99.99%.非父排除率介于0.3067,0.6727之间，15个常染色体STR基因座的累积非父排除率达到99.99%.各基因座的匹配概率介于0.0447,0.2552，其累积匹配概率为4.8691×10-17.对云南怒江地区白族群体与云南独龙、云南怒族、云南景颇族(数据未发)和南方汉族等5个人群的遗传距离作出比较. 3讨论 STR在人基因组中出现的数目和频率不同，从而表现出遗传多态性。由于STR基因座在群体之间和群体内部的异质性水平较高，受到地理，语言等诸多因素的影响，所以在将STR应用于人类群体学研究和法医个体识别和亲权鉴定时，必须对该群体进行多态性调查。且需杂合度(H)、多态信息量(PIC)、个体识别力(DP)等指标均符合较高 遗传多态性要求。本研究的PM=4.8691×10-17。同时在本群体中，15个STR基因座的累积个人识别概率和累积非父排除概率均高于0.9999。说明实验所选择的这15个常染色体STR遗传标记在进行白族群体遗传学研究和相关应用研究时是极有价值的。 将云南怒江白族124名无关个体数据与已经报道的云南独龙族、云南怒族、南方汉族及未报道的云南景颇族的15个常染色体STR基因座遗传距离进行比较，发现不同民族存在差异。在系统进化树中看到景颇族与怒族出自同一支，而怒江白族与独龙族和汉族出自另一支，他们在基因数据上更为相近。当地的地理环境和云南的历史也恰好说明这一结果的合理性。首先，怒江作为独龙族主要聚居地，其地理环境与外界相对隔离封闭，这使怒江白族和独龙族之间的交流融合更加频繁和多样化。其次，对于汉族，陆韧等认为历史上汉族迁移云南的活动在很早以前就已经出现，唐以前进入云南的汉人与当地民族融合为“白蛮”，而唐宋时期又有几十万汉人由于战乱、饥荒、掳掠而进入云南，这批迁移者被南诏、大理统治者融合到白族之中。直至元代，云南与内地的政治经济制度、生产关系和儒学文化氛围等方面逐渐接近，进入云南的汉人能够终元一代“保其世籍”不改，标志着云南汉族“白族化”倾向的基本中断，走上了与云南各民族共同发展的道路。这个学说也刚好印证了此次研究所作出的系统进化树。本研究所得数据亦可为汉族群体的起源迁徙变化作更进一步的了解，亦对云南怒江白族起个体识别和亲权鉴定提供资料。