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2011年北京市儿童携带A组链球菌的M蛋白基因分型研究

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2011年北京市儿童携带A组链球菌的M蛋白基因分型研究 生坐塑堕医生苤查垫!!生!!旦笠堑鲞錾!!翅£!坚』旦型丛鱼:坠!堡巴!些垫!!:!!!:堑:丛!:!1 2011年北京市儿童携带A组链球菌的 M蛋白基因分型研究 李静刘爽彭晓曼扬鹏张代涛吴双胜梁慧洁崔淑娟段玮卢桂兰 王全意 【摘要】 目的了解2011年北京市儿童携带A组链球菌(GAS)的M蛋白基因(emm)各基因型 别分布情况。方法于2011年5—7月.从北京市36家医院儿科『J、急诊中选取猩红热和咽部感染 患者作为调查对象,共3315例。采集调查对象咽拭子标本,分离GAS菌株。应用PCR法扩增emm 基因,...
2011年北京市儿童携带A组链球菌的M蛋白基因分型研究
生坐塑堕医生苤查垫!!生!!旦笠堑鲞錾!!翅£!坚』旦型丛鱼:坠!堡巴!些垫!!:!!!:堑:丛!:!1 2011年北京市儿童携带A组链球菌的 M蛋白基因分型研究 李静刘爽彭晓曼扬鹏张代涛吴双胜梁慧洁崔淑娟段玮卢桂兰 王全意 【摘要】 目的了解2011年北京市儿童携带A组链球菌(GAS)的M蛋白基因(emm)各基因型 别分布情况。方法于2011年5—7月.从北京市36家医院儿科『J、急诊中选取猩红热和咽部感染 患者作为调查对象,共3315例。采集调查对象咽拭子标本,分离GAS菌株。应用PCR法扩增emm 基因,进行测序,确定GAS的emm基斟型别,并比较不同人群、不同疾病间的eY/h-ll基因型别的差异。 结果3315份咽拭子标本中,分离出633株GAS菌株,其中elnm基因阳性菌株共610株,故最终有 610倒患者纳入研究,其中,猩红热患者448例(73.4%),咽部感染患者162例(26.6%);城区397例 (651%),郊区213例(34.9%);1—5岁儿童240例(394%),6~18岁儿童369例(606%)。共鉴 定出8种eml,l基因型(猩红热患者:6种,咽部感染患者:4种)和2】种emlll基因亚型(猩红热患者: 16种,咽部感染患者:10种),包括3种新的cram亚型,分别是emml63、emml262和s61“20,其 中,emml.63在猩红热和咽部感染患者中均存在,而emml2.62和st5144.20仅见于咽部感染患者。 emml2基因型所占比例最高,为805%(491/610).其次是emml,占180%(110/610);基因亚型中, emml200所占比例最高,为69.0%(421/610),其次是eraml.00f169%(103/610)1和emml219 [61%(37/610)],均是猩红热和咽部感染患者的主要流行菌株。流行菌株的分布在分离地区和宿 主年龄上存在差异,郊区患者emml、emml.00和emml2.19构成比『分别为221%(47/213)、19.2% (40/213)、8O%(17/213)j高于城区患者[分别为159%(63/397)、15.6%(62/397)、5o%(20/ 397)],差异有统计学意义(P(o05)]。emml00在6—18岁年龄组构成比[192%(71/369)]高于 1—5岁年龄组[133%(32/240)],差异有统计学意义(x2=845,P<005)。结论2011年北京市 儿童携带GAS的啪m基因型别中,主要流行的基因型是enanl2和emnll,主要流行的基因亚型是 emml200、emmI00和emml219,其分布在分离地区和宿主年龄上存在差异。 【关键词】链球菌,酿脓;猩红热;疫苗;earn基因 StudyOntypesofMproteingeneingroupAstreptococcusisolatedfromchildreninB蜘ing,2011 L/.1ing‘,UUShuang,PEmcXizw—rain,YANCPeng,ZHANGDai-too.WUShuang—sheng,LIANGttui- 皿,c叫Shu-juan,DUANWei,LUGui·lan,吼ⅣGQm”yi’SchoolofPublicHealthandFamily Medici聊.CapitalMedicafUniversity.Beijing100069.China Correspondingauthor:WANG0啪一一,Email:自如函M珊@126.corY‘ 【Abstract】ObjectiveToexplorethedistributioncharacteristicsofthetypesofMproteingene (elTlm)ingroupA streptococcus(GAS)isolatedfromchildreninBeijingintheyear2011. McthodsDuri.gMaytoJulyin2011atotalof3315patientswho愀-diagnosedscarletfeveror pharyngealinfectionbydoctorsinpediatricoutpatientandemergencyunitsof36hospitals.wereselected目 subieetsTheirthroatswabsamplesweTecollectedandiselatedthesixainsofGAS.Geneemmwasthen amplifiedandsequencedbyPCRmethed.andthedifferenceslntypesofgeneemm1mtweendifferent populationsanddiseaseswerecompared.ResultsAtotalof633strainsofGASwereisolatedfromthe3315 throatswabsamples.610strainsoutofwhich⋯genem⋯positiveartdmreemitedinthestudy.Out ofthe610recruitedstrains,448(73.4%)wereisolatedfromscarletfeverpatients,theother162(266%) DOI:10.3760/cm“】issn0253-9624.201212013 基金项目:科技部t二五重大专项(20t2ZXl0004215—003430);北京市科技新星计划项目(20t1047) 作者单位:100069北京,首都医科大学公共卫生与家庭医学学院(李静);北京市疾病预防控制中心传染病地方 病控制所(李静、刘樊、彭晓曼、杨鹏、张代涛、吴双胜、粱慧沽、崔淑娟、段玮、卢桂兰、王全意) 通信作者:王全意,E瑚il:bjedexm@126帅m 论著. 万方数据 生生题喳匡兰堑茎垫!!I:11旦望坐叠錾l!刿些!』!!!坠型-1’!!!!!!!!!l!:!!!.!生』i!』! we』tisolatcI】m㈣【,hap,ngealinfe‘一tin.patients:397(651%)Merefromurban,“1Pother213(349%) we/-pfrI)msuburb:240(394%)werefrompatientsagingbet、*eenl一5yearsold,【}Ieother369(606%)㈣frompatientsagin96一】8),earsoldAtotalof8typesofgeneelnlll(sere'letfeV⋯:6types,pharyngea] infelllon:4types)a.d21subt)pesofgeneenln(scarletfever:16subtypes,pharyngealinfection:10 suhIvI,rs)黼idelltiffrtI,rh⋯⋯wubtvpr㈣foundinthestudy,namingemml63,enlnil262and st514420Amongthememml63wasfountlbothinscarlet缸verandpharyngealjnfeetionpatients,while elnml2 62and‘6】4q20wereonlyfoundinpharyngealinketlonpatientsAmongallthetypesofgone’ emm.enlnll2aeeounle[Iforthehighestpercentagea‘805%(491/610)andthenfollov,el{hvChillil (180%(110/610))Amongallthesubtypes,thedominant‘ubtypewasemnll200,alceountingh 690%(421/610),folh,ningbvrmm00(169%(103/610))andelHml219(6J%(37/610)).AI】 thealJ【)retypPHandsnl)p,11eRofgene㈣wPrPthenine[prexMontstrains㈣narielfevc7palienlsr"1.1 pharyngeallhi?etionpatientsSignificantdi隔renceslnthedistriImtionotprevalentstrainswereobserveri among,:aftflusdgingpatientsan(1regionsTheeonstihlenlratiosc汀p.mn]1.emml00andenlml219wrrP hl曲Prinpalienlsfmmsuhurb(emml:221昵(47/213),⋯111100:192%(40/213),emml219: 80%(17/213))thatlthoselnurbanareas(emml.159%(63/397).t÷mllll00.156%(62/397). emFlll219:50%(20/397))Tiledifferen(eshowellslatisti‘,aIsignificance(P<0.05)Theconsfituenl ratioofcnlnll009,-05higheramongpatientsaging6一l8Years¨J{l(192%(71/369))thanthoseaging 1—5yearsohi(133%(32/240))Thedi雎reneealsoshowerIstatisticalsignificance(X’:845,P< 0051 ConclusionAmongthetypesofgeneemminGAS1solatetlfromchildreninBeijing111year20lI. theIIinstprevalenttv.owPrrenlnll2andelnnll.antltilemostpre、alentI。Hlmsubtypeswereemml20(), elllllll00ail(iemml219 Asignifit,antdifferenceintheirdistributionIlet"e,eenvariousagingpatientsn刊 isolatedplaces('allbeohvicmsly“1un(1 【Keywords】Streploeoe(·iispyogenes;Scarletfever;Vaccines;Geneernm A组链球菌(groupAstreptococcus,GAS)叉称 酿脓链球菌.是引起儿童感染性疾病的重要致病菌。 近年来,全球GAS感染性疾病负担较严重。。“,已经 成为全球公共卫生问题一2011年北京市猩红热患 者明鼎增多,而不同型别的A组链球菌的致病性不 同,因此,了解GAS的型,Nx,J-于其流行病学的研究 具有重要意艾。M蛋白基因(encodingmatureM proleingene,emlll)编码M蛋白,其3’端高度保守, 而5’端高度变异,是GAS型别特异性的基础’,根 据这一特点可以把GAS分成不同的elnm基因犁, 基本原理是应用通/tj引物,通过PCR扩增及测序获 得emlla基因的5’端nf变区域,将序列上传至相关数 据库,进行elllm基冈序列的比较,确定emm基 因型及亚型4 该方法具有准确、快速的特点。因 此,笔者应tI=}jetllm基因分型技术对2011年北京市 儿童携带A组链球菌的流行菌株进行分析,了解北 京市GAS菌株流行情况。 对象与方法 1.对象:干2011年5—7月从北京市36家猩红 热病例较多的医院的儿科门诊、急诊中选取诊 断为咽部感染(包括链球菌感染、扁桃体炎、咽峡 炎)或猩红热的患者作为研究对象,其3315例。收 集患者人口学特征信息、主要临床表现、临床检查结 果和临床诊断结果一 2样本采集:经患者知情同意,应用北京市 CDC绕一提供的咽拭了,采集患者口N拭子标本,共 3315份。将采集的拭子直接浸入采样肉汤液巾, 24h内送至北京市CDC实验室。将咽拭子标本接 种于50ml/L脱纤维羊血的胰大豆蛋白胨血琼脂平 板上,于370c体积分数为5%的CO:恒温箱中孵 育24h。根据血平板的形态特征及其/3溶血环,应 用英国Oxoid公司生产的链球菌分群诊断试剂对 GAS的菌落进行鉴定。 3基因检测:应1L}j上海之江生物科技有限公司 提供的细菌DNA提取试剂,提取GAS的DNA。应 用PCR扩增emm的N末端片段,引物采用美国 CDC网站公布的erllm基因分型引物,上游序列: 5’一TATT(C/G)GCTTAGAAAATFAA一37,下游序列: 5’一GCAAG‘几℃7ITCAGC‘ITG'ITI’1--3‘。PCR反应条件: 95℃预变性5min:95甲变性20s,50℃退火45s, 72℃延伸90s,30个循环172qC延伸5min;产物 4。c恒温保存。将扩增产物进行纯化,应用测序引 物:5’-TAlTrcGcTTAGAAAATTAAAAAcAcG一3’进行 测序,最后将得到的核酸测序结果与美国CDC提供 的序列(http://”,wcdc.gov/ncidod/biotectCstrep/ strephiasthim)进行同源性比对,判断emlrll基因 分型, 4统计。学分析:用Epidata3 1软件建立数据 库,数据进行双录入。使用SPSS13.0进行统计分 析。采用x!检验和Fisher精确概率检验比较不同 人群、不同疾病间的emm基冈型别的差异,以 P(0.05为差异有统i{学意义 万方数据 尘茔塑陵墼芏苤盍垫11生l!旦苤堂堂筮!!型!!坐』!堡!丛旦:望!!!丝坚垫!!:!!!:堂,坠!! 结 果 1. ·般情况:3315份咽拭子标本中,分离出 633株GAS临床菌株,其中elllin基吲阳性菌株共 610株,故最终有610例患者纳入研究,其中,男性 382例(62.6%),女性228侧(37.4%);城区397例 (651%),郊区213例(34.9%);研究对象年龄中 位数是6岁,1~5岁儿童240例(39.4%),6~18岁 儿童369例L606%);猩红热患者“8例 (73.4%),咽部感染患者162例(266%),见表1。 表l不同特征研究对象患病情况 特}l}= 猩红热患者 (448例) 咽部感染患者 (162例) 性别 男 女 地区 城区 郊区 年龄(岁) 1~5 6~18 292(479) 90(i48 156(256) 72(118 270(443) 178f292) 202(3321 246f404) 127(20.8) 35(57) 38(62) 123(202) 382(626 228f374 397(651) 213(349) 240(394) 369(606) 合计448(734) 162(26.6) 610(100.0 注:括号外数值为患者数(例),括号内数值为构成比(%) 2.emm基因型别分布:610株enlm基冈阳性 GAS菌株中,共鉴定出8种ell3m基因型和21种 elTim基围亚型。其中,猩红热患者中共鉴定出6种 emll3基闰型和16种emm亚型,咽部感染患者共鉴 定出4种e1]Ellll型和10种emm亚型。在emll,l亚型 中发现3种新的型刷,分别是emml.63、emml262 和st5144.20,其巾,ellainl.63在猩红热和咽部感染 患者中均存在,而emml2.62和st5144.20仅见于咽 部感染患者。在鉴定出的8种emm基因型中, emml2所占比例最高,占80.5%(491/610),其次是 emm],占18O%(1IO/610)。在emm基因亚型中, emml200占69.O%(421/610),其次是emml.00, 占169%(103/610).emml2.19占6.1%(37/ 610),这3种型别共占总数的92.O%(561/610),其 他emm亚型分布情况,见表2。在两种疾病中丰要 流行菌株相同,均是基因型ernml2[猩红热患者: 79.7%(357/448);咽部感染患者:82.7%(134/ 162)]、emml[猩红热患者:19.2%(86/448);咽部 感染患者:148%(24/162)]和基冈亚型cmml2.00 l猩红热患者:67.O%(300/448);咽部感染患者: 74.7%(121/162)]、emml.00[猩红热患者:18.1% (81/448);咽部感染患者:13.6%(22/162)]、 emml2.19[猩红热患者:65%(29/448);咽部感染 患者:4.9%(8/162)]。同时,流行菌株在这两种疾 病中的分布均较接近,差异无统计学意义(P> 0.05)。 表2 A组链球菌M蛋白基因各型别在不同患者中的 分布情况 基圊型 业型 猩红热皇者 嘤部感孳患者 合H (448例) (162例) ⋯ 300(67o) 1(02) 16(36) 2(04) 3(07) 29(65) 1(o2) 3(o7) o(o.o) 2(o4) 0(0.0、 8 l 0 81j 2) .0) 9) l(02) 2(o4) 1(o2) 0(o0) I(02) 0(0.0) 21(747 0(0.o) o(00) 0(00) 2(12) 8(49) o(oo) o(oo) 2(12) 0(o0) l(O6、 22 0 l l 421【69o) l(02) 16(26) 2(03) 5(08) 37(61) l(o2) 3(o5) 2(o3) 2(o3) 1(O2、 136) 103 o0) 1 o6) 1 061 5 o(0o 0ro0 o(o0 3(19 o(0o 169) 02) 02) o8) !!!:!! !垫!!—— 合汁488(100.o)162(100o)610(1000) 注:括号外数值为患者数(例),括号内数值为构成比(%) 3.emm基因型人群差异:本次研究中GAS流 行菌株基因型为emml2(491株)和emml(110株), 基因亚型为emm]2.00(421株)、emml.00(103株) 和cmml2.19(37株)。上述流行菌株在不同人群中 的分布情况见表3。主要流行菌株的基因型和亚型 在男、女问的分布率均较接近,差异无统计学意义。 城区儿童中enmll2的构成比高于郊区儿童,而 emml的构成比低于郊区儿童,差异有统计学意义; ermnl.00和emml2.19在郊区儿童中的构成比均高 于城区儿童,而emml2.oo在城区儿童中的构成比 2 3 2 5 2 0 O 0 0 0 2 , l 一 ∞∞加¨控伸舢∞鲫”缸 o,,, o ∞ ∞ ∞ ∞ 砌 ~ ㈣蝴枷Ⅶ挑瑚蚴蚴瑚瑚m 瑚岱m m 瑚 ㈤ 枷 ㈣ ㈣ ㈨焉=====:=掣舞篓{{ril蔗一 万方数据 生堡强蚯匡生赶盍2Q12生12且嚣堑鲞噩12塑£bm』堕!丛型:坠§!£虫b!12Q12:!Q!:堑,旦g上 表3不同特征患者M蛋白基因各型别分布情况比较 注:emm为M蛋白基因;括号外数值为构成比(%),括号内数值分子代表各㈣基因型别患者散(例),分母代表不同特征人群患者教(例 高于郊区儿童.差异具有统计学意义。不同年龄组 间,基因型emml2、emm|的构成情况较接近,差异 无统计学意义;基因韭型emml,∞在6~18岁年龄 组中的构成比较高,而emml2.00和emml2.19在 1~5岁组中构成比较高,差异有统计学意义。 讨 论 笔者研究发现,2011年北京市儿童携带GAS的 菌株型别中,优势菌型是emml2及其亚型 emml2.00,而2007年优势菌型为emml.00”。,这可 能与GAS的M蛋白特异性抗体有关6。另外,也 可能是GAS基因片段发生改变所致⋯。但是,导致 GAS优势菌型发生变化的具体原因,有待进一步 调查。 本次研究结果与我国其他地区调查结果存在差 异,如广州地区主要流行emml[sJ,而与全国调查结 果相似”1。与其他国家主要流行菌株问也存在差 异,如美国主要流行emml,芬兰主要流行 emm28om-t:’i。可见.不同地区GAS的流行菌株存在 差异,其原因可能与地理环境、人群生活习惯及免疫 水平差异有关。 有研究表明,同一国家不同地区,GAS流行菌 株型别可能不同‘“”。。本研究结果显示,北京市城 区和郊区闷GAS流行菌株的分布存在差异。原因 可能是城、郊之间儿童免疫水平不同,此外,也可能 与两个地区的地理环境、医疗水平相关。 笔者发现,emml2.I)0、emml2.19在1—5岁组 患者中的构成比高于6~18岁组。有研究表明, emml2的分布随年龄的增加呈下降趋势”“,说明低 年龄儿童更易携带基因型为emml2的GAS菌株。 出现这种情况的原因可能与机体感染GAS后产生 的特异性抗体保护其避免同型GAS再感染有关。 笔者还发现,从猩红热患者和咽部感染患者中 分离的GAS流行菌株均以emml2和emml为主,与 我国其他地区研究相似‘”,说明导致北京市儿童 患猩红热和咽部感染的GAS菌株流行情况与全国 流行情况基本相符。 疫苗是预防传染病流行的重要防护措施”⋯。 研究表明,美国研制的26价多肽疫苗在控制GAS 感染性疾病中发挥了作用,该疫苗是由4条融合蛋 白构成,分别包含26种流行菌株M蛋白的N端多 肽序列及1种新发现的保护性抗原的N端多肽序 列”“,目前,该疫苗所包含的26种基因型别,覆盖 了80%一90%的北美流行菌株””1。本次研究共 发现8种einm基因型别,其中emml、etnm4、 emml2、emm22、emm75、emm89都包含在26价多肽 疫苗中,可见,该疫苗可以有效防治北京审GAs所 致疾病的流行,但疫苗的推广需要了解不同地区、不 同时期GAS菌株流行情况,但目前我国仍缺乏对 GAS菌株的监测,提示应开展GAS菌株长期监测, 为研制出适合我国的多肽疫苗提供依据。 参考文 献 1]CampetisJR,SteerAC,MulhollandEK.etal TheglobalbuMen ofgmupAstreplrmoccaldiseasesLancetInfectDis,2005,5 万方数据 虫堡盟陵堡堂盘查垫!!垩!!旦墨堂堂翌!!塑!!鱼』堕!坚型:旦竺墅!些垫望:坠!:堑:盟!!! 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