06_细胞质基质与细胞内膜系统

null第六章 细胞质基质与细胞内膜系统第六章 细胞质基质与细胞内膜系统 细胞质基质  内 质 网  高尔基体  溶酶体与过氧化物酶体  细胞内蛋白质的分选与细胞结构的组装 第一节 细胞质基质第一节 细胞质基质 细胞质基质 （cytoplasmic matrix or cytomatrix）  细胞内膜系统 （endomembrane system） 第二节 内 质 网第二节 内 质 网 内质网(endoplasmic reticulum,ER)的形态结构  ER的功能 内质网与基因表达的调控 第三节 高尔基体第三节 高尔基体 高尔基体的形态结构  高尔基体的功能  高尔基体与细胞内的膜泡运输 第四节 溶酶体与过氧化物酶体第四节 溶酶体与过氧化物酶体 溶酶体几乎存在于所有的动物细胞中。溶酶体（lysosome）是单层膜围绕、内含多种酸性水解酶类的囊泡状细胞器。其主要功能是进行细胞内的消化作用。  溶酶体的结构类型  溶酶体的功能  溶酶体的发生  溶酶体与过氧化物酶体第五节 细胞内蛋白质的分选与细胞结构的组装第五节 细胞内蛋白质的分选与细胞结构的组装 分泌蛋白合成的模型---信号假说  蛋白质分选与分选信号  膜泡运输  细胞结构体系的组装 一、细胞质基质 （cytoplasmic matrix or cytomatrix） 一、细胞质基质 （cytoplasmic matrix or cytomatrix） 细胞质基质是细胞的重要的结构成分，其体积约占细胞质的一半 细胞质基质的涵义 细胞质基质的功能 肝细胞中细胞质基质及细胞其它组分的数目及所占的体积比（引自Albert.1998） null 基本概念： 用差速离心分离细胞匀浆物组分，先后除去细胞核、线粒体、溶酶体、高尔基体和细胞质膜等细胞器或细胞结构后，存留在上清液中的主要是细胞质基质成分。生物化学家称之为胞质溶胶。  成分：中间代谢有关的酶类、细胞骨架结构。  特点：细胞质基质是一个高度有序的体系；通过弱键而相互作用处于动态平衡的结构体系。 细胞质基质的涵义null 完成各种中间代谢过程 如糖酵解过程、磷酸戊糖途径、糖醛酸途径等.  与细胞质骨架相关的功能 维持细胞形态、运动、胞内物质运输及能量传递等.  蛋白质的修饰、蛋白质选择性的降解  蛋白质的修饰  控制蛋白质的寿命  降解变性和错误折叠的蛋白质  帮助变性或错误折叠的蛋白质重新折叠 细胞质基质的功能二、细胞内膜系统 （endomembrane system）二、细胞内膜系统 （endomembrane system）  细胞内膜系统概述  细胞内膜系统的研究方法 细胞内膜系统概述细胞内膜系统概述细胞内膜系统是指细胞内在结构、功能及发生上相关 的由膜包绕形成的细胞器或细胞结构。  真核细胞的区域化（compartmentalization）： 细胞骨架纤维为组织者的Cytomatrix形成 有序的动态结构； 细胞内的膜相结构----细胞器（organelles）。 细胞内膜系统的研究方法 细胞内膜系统的研究方法 De Duve, A.Claude and G.Palade,1974 Nobel Plrize  放射自显影（Autoradiography）  生化分析（Biochemical analysis）  遗传突变分析（Genetic mutants） 一、 内质网的形态结构一、 内质网的形态结构 内质网的两种基本类型 粗面内质网（ rough endoplasmic reticulum，rER） 光面内质网（smooth endoplasmic reticulum，sER） 微粒体（microsome） 二、ER 的 功 能二、ER 的 功 能 ER是细胞内蛋白质与脂类合成的基地，几乎全部脂类和多种重要蛋白都是在内质网合成的。  rER的功能  sER的功能 rER 的 功 能rER 的 功 能  蛋白质的合成  蛋白质的修饰与加工 新生肽的折叠与组装  脂类的合成 sER的功能sER的功能  类固醇激素的合成（生殖腺内分泌细胞和肾上腺皮质）  肝的解毒作用（Detoxification） System of oxygenases---cytochrome p450 family；  肝细胞葡萄糖的释放（G-6PG）  储存钙离子：肌质网膜上的Ca2+-ATP酶将细胞质 基质中Ca2+ 泵入肌质网腔中 返回 蛋白质合成 蛋白质合成分泌蛋白；整合膜蛋白；内膜系统各种细胞器内的可溶 性蛋白（需要隔离或修饰），易位子（translocon) 其它的多肽是在细胞质基质中“游离”核糖体上合成的： 包括：细胞质基质中的驻留蛋白、质膜外周蛋白、核输入 蛋白、转运到线粒体、叶绿体和过氧物酶体的蛋白。 注意：细胞中蛋白质都是在核糖体上合成的， 并都是起始于细胞质基质中“游离”核糖体。 蛋白质的修饰与加工蛋白质的修饰与加工修饰加工：糖基化、羟基化、酰基化、二硫键形成等 糖基化在glycosyltransferase作用下发生在ER腔面 N- linked glycosylation（Asn） O- linked glycosylation（Ser/Thr or Hylys/Hypro） 酰基化发生在ER的细胞质基质侧：软脂酸→Cys 新生肽的折叠与组装 新生肽的折叠与组装  新生肽的折叠组装：非还原性的内腔，易于二硫键形成；  正确折叠涉及驻留蛋白：具有KDEL or HDEL信号 蛋白二硫键异构酶（protein disulfide isomerase，PDI） 切断二硫键，帮助新合成的蛋白重新形成二硫键并处 于正确折叠的状态  结合蛋白（Binding protein，Bip，chaperone）  识别错误折叠的蛋白或未装配好的蛋白亚单位， 并促进重新折叠与装配。 脂类的合成 脂类的合成  ER合成细胞所需绝大多数膜脂（包括磷脂和胆固醇）。 两种例外 鞘磷脂和糖脂（ER开始→Golgi complex完成） Mit/Chl某些单一脂类是在它们的膜上合成的。   各种不同的细胞器具有明显不同的脂类组成： phosphatidylcholine（PC）：ER→GC→PM（高→低） phosphatidylserine（PS）：PM→GC→ER（高→低） 表明在膜上含有不同的磷脂修饰酶。  磷脂合成酶是ER膜整合蛋白，活性位点朝向cytosol；  磷脂的转运: transport by budding：ER→GC、Ly、PM transport by phospholipid exchange proteins（PEP）： ER→other organelles（including Mit and Chl）。三、内质网与基因表达的调控三、内质网与基因表达的调控 内质网蛋白质的合成、加工、折叠、组装、转运及向高尔基体转运的复杂过程显然是需要有一个精确调控的过程。 影响内质网细胞核信号转导的三种因素：  内质网腔内未折叠蛋白的超量积累。  折叠好的膜蛋白的超量积累。  内质网膜上膜脂成份的变化——主要是固醇缺乏不同的信号转导途径，最终调节细胞核内特异基因表达 一、高尔基体的形态结构一、高尔基体的形态结构 电镜下高尔基体结构是由扁平膜囊和大小不等的囊泡构成  高尔基体是有极性的细胞器：位置、方向、物质转运与生化极性  高尔基体各部膜囊的４种标志细胞化学反应：  高尔基体至少由互相联系的4个部分组成，每一部分又能划分出更精细的间隔 高尔基体与细胞骨架关系密切，在非极性细胞中，高尔基体分布在MTOC(负端) 高尔基的膜囊上存在马达蛋白（cytoplasmic dynein和kinesin）和微丝的马达蛋白（myosin）。最近还发现特异的血影蛋白（spectrin）网架 。它们在维持高尔基体动态的空间结构以及复杂的膜泡运输中起重要的作用。 null 扁囊弯曲成凸面又称形成面（forming face） 或顺面（cis face） 面向质膜的凹面（concave）又称成熟面（mature face）或反面（trans face） 高尔基体各部膜囊的４种标志细胞化学反应高尔基体各部膜囊的４种标志细胞化学反应 嗜锇反应的高尔基体cis面膜囊； 焦磷酸硫胺素酶（TPP酶）化学反应，显示trans面1～2层膜囊  胞嘧啶单核苷酸酶（CMP酶）化学反应，显示靠近trans面膜囊状 和管状结构。 GERL结构：60年代初，Novikoff发现CMP和酸性磷酸酶存在于高尔基体的一侧，称这种结构为GERL，意为与高尔基体（G）密切相关，但它是内质网（ER）的一部分，参与溶酶体（L）的生成 烟酰胺腺嘌呤二核苷磷酸酶（NADP酶）的细胞化学反应，显示中间扁平囊 null高尔基体顺面网状结构（cis-Golgi network， CGN）又称cis膜囊 高尔基体中间膜囊（medial Golgi） 多数糖基修饰； 糖脂的形成； 与高尔基体有关的多糖的合成 高尔基体反面网状结构（trans Golgi network，TGN） 周围大小不等的囊泡 顺面囊泡称ERGIC(ER-Golgi intermediate compartment) 反面体积较大的分泌泡与分泌颗粒 高尔基体的4个组成部分高尔基体顺面网状结构 高尔基体顺面网状结构  RER（蛋白质和脂类）——（蛋白质KDEL或HDEL）CGN； 蛋白丝氨酸残基发生O--连接糖基化； 跨膜蛋白在细胞质基质一侧结构域的酰基化； 日冕病毒的装配 高尔基体反面网状结构 高尔基体反面网状结构  TGN中的低pH值；标志酶CMP酶阳性  TGN的主要功能： 参与蛋白质的分类与包装、运输； 某些“晚期”的蛋白质修饰 （如唾液酸化、蛋白质酪氨酸残基的硫酸化及蛋 白原的水解加工）在蛋白质与脂类的转运过程中 的“瓣膜”作用，保证单向转运 二、 高尔基体的功能二、 高尔基体的功能  高尔基体与细胞的分泌活动  蛋白质的糖基化及其修饰  蛋白酶的水解和其它加工过程 高尔基体与细胞的分泌活动 高尔基体与细胞的分泌活动 蛋白质的分选及其转运的信息仅存在于编码该蛋白质的基因本身 · 流感病毒囊膜蛋白特异性地转运 上皮细胞游离端的质膜 ·水泡性口炎病毒囊膜蛋白特异性地转运上皮细胞基底面的质膜 ·水泡性口炎病毒囊膜蛋白等膜蛋白在胞质基质侧的双酸分选信号 Asp-X-Gln或DXE）起重要的作用  溶酶体酶的分选：M6P反面膜囊M6P受体 在肝细胞中溶酶体酶还存在不依赖于M6P的另一种分选途径。 蛋白质的糖基化及其修饰蛋白质的糖基化及其修饰  蛋白质糖基化类型  蛋白质糖基化的特点及其生物学意义  蛋白聚糖在高尔基体中组装 植物细胞中高尔基体合成和分泌多种多糖 蛋白质糖基化类型蛋白质糖基化类型N-连接与O-连接的寡糖比较 蛋白质糖基化的特点及其生物学意义蛋白质糖基化的特点及其生物学意义糖蛋白寡糖链的合成与加工都没有模板，靠不同的酶在细胞不同间隔中经历复杂的加工过程才能完成。 糖基化的主要作用是蛋白质在成熟过程中折叠成正确构象和增加蛋白质的稳定性；多羟基糖侧链影响蛋白质的水溶性及蛋白质所带电荷的性质。对多数分选的蛋白质来说，糖基化并非作为蛋白质的分选信号。 进化上的意义：寡糖链具有一定的刚性，从而限制了其它大分子接近细胞表面的膜蛋白，这就可能使真核细胞的祖先具有一个保护性的外被，同时又不象细胞壁那样限制细胞的形状与运动。  蛋白聚糖在高尔基体中组装 与丝氨酸残基相连的是木糖，而不是N－乙酰半乳糖胺  植物细胞中高尔基体合成和分泌多糖  蛋白聚糖在高尔基体中组装 与丝氨酸残基相连的是木糖，而不是N－乙酰半乳糖胺  植物细胞中高尔基体合成和分泌多糖蛋白质在高尔基体中酶解加工的几种类型 加工方式多样性的可能原因： 确保小肽分子的有效合成； 弥补缺少包装并转运到分泌泡中的必要信号； 有效地防止这些活性物质在合成它的细胞内起作用。 肽链酪氨酸残基的硫酸化作用 蛋白质在高尔基体中酶解加工的几种类型蛋白质在高尔基体中酶解加工的几种类型 无生物活性的蛋白原（proprotein）高尔基体 切除N-端或两端的序列成熟的多肽。如胰岛素、胰高血糖素及血清白蛋白等。  蛋白质前体高尔基体水解同种有活性的多肽，如神经肽 含有不同信号序列的蛋白质前体高尔基体加工成不同的产物。 同一种蛋白质前体不同细胞、以不同的方式加工不同的多肽。 三、高尔基体与细胞内的膜泡运输三、高尔基体与细胞内的膜泡运输高尔基体在细胞内膜泡蛋白运输中起重要的枢纽作用膜泡运输的主要途径,其中多数与高尔基体直接相关一、溶酶体的结构类型一、溶酶体的结构类型 溶酶体的发现  溶酶体膜的特征：一种异质性（heterogenous)的细胞器  嵌有质子泵，形成和维持溶酶体中酸性的内环境；  具有多种载体蛋白用于水解的产物向外转运；  膜蛋白高度糖基化，可能有利于防止自身膜蛋白的降解  溶酶体的标志酶：酸性磷酸酶（acid phosphatase）  类型类 型类 型初级溶酶体（primary lysosome） 次级溶酶体（secondary lysosome）  自噬溶酶体（autophagolysosome）  异噬溶酶体（phagolysosome） 残余小体（residual body），又称后溶酶体。 溶酶体是以含有大量酸性水解酶为共同特征、不同形态大小，执行不同生理功能的一类异质性 （heterogenous）的细胞器 。二、溶酶体的功能二、溶酶体的功能清除无用的生物大分子、衰老的细胞器及衰老损伤和死亡的细胞 防御功能（病原体感染刺激单核细胞分化成巨噬细胞而吞噬、消化）  其它重要的生理功能  溶酶体与疾病 溶酶体的基本功能是对生物大分子的强烈的消化作用，这对于维持细胞的正常代谢活动及防御微生物的侵染都有重要的意义。其它重要的生理功能 其它重要的生理功能 作为细胞内的消化“器官”为细胞提供营养； 分泌腺细胞中，溶酶体摄入分泌颗粒参与分泌过程的调节 参与清除赘生组织或退行性变化的细胞； 受精过程中的精子的顶体（acrosome）反应。 抗原加工。 溶 酶 体 与 疾 病 溶 酶 体 与 疾 病 溶酶体酶缺失或溶酶体酶的代谢环节故障，影响细胞代谢，引起疾病。如台-萨氏（Tay-Sachs）等各种储积症（隐性的遗传病）。 某些病原体（麻疯杆菌、利什曼原虫或病毒）被细胞摄入，进入吞噬泡但并未被杀死而繁殖（抑制吞噬泡的酸化或利用胞内体中的酸性环境）。 I细胞疾病：N－乙酰葡萄糖胺磷酸转移酶单基因缺陷 三、溶酶体的发生三、溶酶体的发生 发生途径  分选途径多样化  酶的加工方式多样化  糖侧链的部分水解、膜蛋白等 发生途径 发生途径 溶酶体酶的合成及N-连接的糖基化修饰（RER） 高尔基体cis膜囊寡糖链上的甘露糖残基磷酸化M6PN-乙酰葡萄糖胺磷酸转移酶高尔基体trans-膜囊和TGN膜（M6P受体）溶酶体酶分选与局部浓缩以出芽的方式转运到前溶酶体磷酸葡萄糖苷酶磷酸化识别信号：信号斑分选途径多样化分选途径多样化 依赖于M6P 的分选途径的效率不高，部分溶酶体酶通过运输小泡直接分泌到细胞外。 在细胞质膜上也存在依赖于钙离子的M6P受体，同样可与胞外的溶酶体酶结合，通过受体介导的内吞作用，将酶送至前溶酶体中，M6P受体返回细胞质膜，反复使用。 还存在不依赖于M6P的分选途径（如酸性磷酸酶、分泌溶酶体的perforin和granzyme） 四、溶酶体与过氧化物酶体四、溶酶体与过氧化物酶体 过氧化物酶体(peroxisom)又称微体(microbody)，是 由单层膜围绕的内含一种或几种氧化酶类的异质性细胞器。  过氧化物酶体与溶酶体的区别  过氧化物酶体的功能  过氧化物酶体的发生过氧化物酶体与溶酶体的区别过氧化物酶体与溶酶体的区别过氧化物酶体和初级溶酶体的形态与大小类似，但过氧化物酶体中的尿酸氧化酶等常形成晶格状结构，可作为电镜下识别的主要特征。 通过离心可分离过氧化物酶体和溶酶体 过氧化物酶体和溶酶体的差别 微体与初级溶酶体的特征比较微体与初级溶酶体的特征比较过氧化物酶体的功能过氧化物酶体的功能动物细胞（肝细胞或肾细胞）中过氧化物酶体可氧化分解血液中的有毒成分，起到解毒作用。过氧化物酶体中常含有两种酶： 依赖于黄素（FAD）的氧化酶，其作用是将底物氧化形成H2O2； 过氧化氢酶，作用是将H2O2分解，形成水和氧气。 过氧化物酶体分解脂肪酸等高能分子向细胞直接提供热能。 在植物细胞中过氧化物酶体的功能： 在绿色植物叶肉细胞中，它催化CO2固定反应副产物的氧化， 即所谓光呼吸反应；  乙醛酸循环的反应，在种子萌发过程中，过氧化物酶体 降解储存的脂肪酸乙酰辅酶A琥珀酸葡萄糖。 过氧化物酶体的发生 过氧化物酶体的发生  氧化物酶体经分裂后形成子代的细胞器，子代的过氧化物酶体 还需要进一步装配形成成熟的细胞器。  组成过氧化物酶体的蛋白均由核基因编码，主要在细胞质基质 中合成，然后转运到过氧化物酶体中。  过氧化物酶体蛋白分选的信号序列（Peroxisomal-targeting signal，PTS）：  PTS1为Ser-lys-leu，多存在于基质蛋白的C端。 PTS2为Arg/Lys-Leu/lle-5X-His/Gln-leu，存在于某些基质蛋白N-端。 过氧化物酶体膜上存在几种可与信号序列相识别的可能的受体蛋白。  过氧化物酶体的膜脂可 能在内质网上合成后转运而来。  内质网也参与过氧化物酶体的发生一、分泌蛋白合成的模型---信号假说一、分泌蛋白合成的模型---信号假说 信号假说(Signal hypothesis) G．Blobel et al：Signal hypothesis,1975  信号肽（Signal peptide）与共转移（Cotranslocation）  导肽（Leader peptide）与后转移（Post translocation） 信 号 假 说信 号 假 说信号假说内容 指导因子： 蛋白质N-端的信号肽（signal peptide） 信号识别颗粒（signal recognition particle，SRP） 信号识别颗粒的受体（又称停泊蛋白docking protein，DP）等 在非细胞系统中蛋白质的翻译过程与SRP、DP和微粒体的关系 在非细胞系统中蛋白质的翻译过程与SRP、DP和微粒体的关系 * “+”和“-”分别代表反应混合物中存在（+）或不存在（-）该物质。信号肽与共转移信号肽与共转移信号肽（Signal peptides）与 信号斑（Signal patches） 起始转移序列和终止转移序列 起始转移序列和终止转移序列的数目决定多肽跨膜次数 跨膜蛋白的取向 导肽与后转移导肽与后转移基本的特征： 蛋白质在细胞质基质中合成以后再转移到这些细胞器中，称后转移（post translocation）。 蛋白质跨膜转移过程需要ATP使多肽去折叠，还需要一些蛋白质的帮助（如热休克蛋白Hsp70）使其能够正确地折叠成有功能的蛋白。 二、蛋白质分选（protein sorting） 与分选信号（sorting signals） 二、蛋白质分选（protein sorting） 与分选信号（sorting signals） 分选途径 分选信号分选途径（Road map） 分选途径（Road map） 门控运输（gated transport）； 跨膜运输（transmembrane transport）； 膜泡运输（vesicular transport） 拓扑学等价性（Topologically equivalent）的维持 三．膜泡运输 三．膜泡运输 膜泡运输是蛋白运输的一种特有的方式，普遍存在于真核细胞中。在转运过程中不仅涉及蛋白本身的修饰、加工和组装，还涉及到多种不同膜泡定向运输及其复杂的调控过程。 三种不同类型的包被小泡具有不同的物质运输作用 。 膜泡运输是特异性过程，涉及多种蛋白识别、组装、 去组装的复杂调控 三种不同类型的包被小泡 具有不同的物质运输作用三种不同类型的包被小泡 具有不同的物质运输作用网格蛋白包被小泡  COPII包被小泡  COPI包被小泡 网格蛋白包被小泡网格蛋白包被小泡负责蛋白质从高尔基体TGN质膜、胞 内体或溶酶体和植物液泡运输。 在受体介导的细胞内吞途径也负责将物 质从质膜细胞质，胞内体溶酶体 高尔基体TGN是网格蛋白包被小泡形成的发源地 COPII包被小泡 COPII包被小泡 负责从内质网高尔基体的物质运输；  COPII包被由5种蛋白亚基组成； 包被蛋白的装配是受控的；  COPII包被小泡具有对转运物质的选择 性并使之浓缩。 COPI包被小泡COPI包被小泡 COPI包被含有8种蛋白亚基，包被蛋白复合物的装配与去装配依赖于ARF； 负责回收、转运内质网逃逸蛋白（escaped proteins） 返回内质网。 细胞器中保留及回收蛋白质的两种机制： 转运泡将应被保留的驻留蛋白排斥在外，防止出芽转运； 通过识别驻留蛋白C-端的回收信号的特异性受体，以COPI-包被小泡的形式捕获逃逸蛋白。  COPI-包被小泡在非选择性的批量运输（ bulk flow ）中行使功能。  COPI-包被小泡除行使Golgi→ER逆行转运外，也可行使顺行转运从ER→ER-Golgi IC→Golgi。 膜泡运输是特异性过程，涉及多种 蛋白识别、组装、去组装的复杂调控膜泡运输是特异性过程，涉及多种 蛋白识别、组装、去组装的复杂调控膜泡融合是特异性的选择性融合 选择性融合基础在于供体膜蛋白与受体膜蛋白的特异性相互作用  在细胞的膜泡运输中，粗面内质网相当于重要的物质供应站，而高尔基体是重要集散中心。由于内质网的驻留蛋白具有回收信号，即使有的蛋白发生逃逸，也会保留或回收回来，所以有人将内质网比喻成“开放的监狱”（open prison）。高尔基体在细胞的膜泡运输及其随之而形成的膜流中起枢纽作用，因此高尔基体聚集在微管组织中心（MTOC）附近并在高尔基体膜囊上结合有类似动力蛋白的蛋白质，从而使高尔基体维持其极性。同样，内质网、溶酶体、分泌泡和细胞质膜及胞内体也都具有各自特异的成分，这是行使复杂的膜泡运输功能的物质基础，但是在膜泡中又必须保证各细胞器和细胞间隔本身成分特别是膜成分的相对恒定。 四、细胞结构体系的组装四、细胞结构体系的组装生物大分子的组装方式： 有些装配过程需ATP或GTP提供能量或其它成份的介入或对装配亚基的修饰 自我装配的信息存在于装配亚基的自身，细胞提供的装配环境 装配具有重要的生物学意义： 分子“伴侣”（molecular chaperones） 生物大分子的组装方式 生物大分子的组装方式 自我装配（self-assembly） 协助装配（aided-assembly） 直接装配（direct-assembly） 复合物与细胞结构体系的组装 装配具有重要的生物学意义 装配具有重要的生物学意义 减少和校正蛋白质合成中出现的错误 减少所需的遗传物质信息量 通过装配与去装配更容易调节与控制 多种生物学过程 分子“伴侣”（molecular chaperones） 分子“伴侣”（molecular chaperones） 细胞中的某些蛋白质分子可以识别正在合成的多肽或部分折叠的多肽并与多肽的某些部位相结合，从而帮助这些多肽转运、折叠或装配，这一类分子本身并不参与最终产物的形成，因此称为分子“伴侣”。 肝细胞中细胞质基质及细胞其它组分的数目及所占的体积比 （引自Albert.1998） 蛋白质的修饰蛋白质的修饰磷酸化和去磷酸化 糖基化：N－乙酰葡萄糖胺 N－端甲基化 酰基化