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应用组学方法研究孕妇血清中唐氏综合征标记物

2017-09-25 50页 doc 2MB 16阅读

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应用组学方法研究孕妇血清中唐氏综合征标记物应用组学方法研究孕妇血清中唐氏综合征标记物 复旦大学 博士学位论文 应用组学方法研究孕妇血清中唐氏综合征标记物 姓名:康媛 申请学位级别:博士 专业:妇产科学 指导教师:李笑天 20100410 复口(人学博十学位论文?中文摘要 的发病机制尚未明了,但上述基因的过表达所引起的广泛效应是,的主要病因。 因此,我们推测是否在胎儿发育阶段已经出现,号染色体基因过表达所导致的病 理生理改变。基因表达的改变可造成一些重要的生化代谢不平衡,母胎作为一个 整体,势必导致孕妇妊娠过程中血清中蛋白质和代谢产物发生改变,这些蛋...
应用组学方法研究孕妇血清中唐氏综合征标记物
应用组学方法研究孕妇血清中唐氏综合征标记物 复旦大学 博士学位 应用组学方法研究孕妇血清中唐氏综合征标记物 姓名:康媛 申请学位级别:博士 专业:妇产科学 指导教师:李笑天 20100410 复口(人学博十学位论文?中文摘要 的发病机制尚未明了,但上述基因的过表达所引起的广泛效应是,的主要病因。 因此,我们推测是否在胎儿发育阶段已经出现,号染色体基因过表达所导致的病 理生理改变。基因表达的改变可造成一些重要的生化代谢不平衡,母胎作为一个 整体,势必导致孕妇妊娠过程中血清中蛋白质和代谢产物发生改变,这些蛋白质 和代,韢物的改变可能对产前筛查唐氏综合征有帮助。 ,,焉,,,,芙】翟懈狙G逦狢,组, 具,数据库对蛋白质的分子功能、生物学过程分类。 结果:,组和,,槟炅浞直鹞,,,,(,昝,,,,士,,岁,孕龄分别为 差异蛋白中,个蛋白,,,,,哂械鞍捉岷瞎δ埽,T斯δ,,,,(,,,酶调 结论: 第二部分构建差异蛋白相互作用网络 材料和方法:,,,治龉ぞ叨圆钜斓鞍坠δ芫劾喾治龊螅,,肐,软件 分子相互作用网络。 结果:差异蛋白的功能聚类主要是脂质运输、酶调节功能、细胞分化发育、 信号通路。差异蛋白与经典的血清学标记物共同参与细胞生长和增殖相互作用网 第三部分应用代谢组学建立产前筛查唐氏综合征模型 复口(入学搏十学位论文幸中文摘要 ,,(,,,,,、,,(,,,,,。 ,,,,,,, ,,, , , ,,,珹 , ,, , , ,,, ,,, ,,,,, ,,,,,, ,,,,, ,,,,, ,,, ,,,,,,,,, , ,, , ,畂, ,,,,, , , , ,,,,, , ,, , ,,,必,,(,, ,,,,,, ,,,,, ,, ,(, ,, ,,,,,,,賑, , ,,,, ,,,,,,,,,,, ,,, , ,, , ,,,,, ,,, ,,,,,,, , ,,,,,,(, ,,,,,, ,,,,,, ,, ,,, ,,,,,, ,,,,, ,,,,, ,,,,,,, ,,,, ,,,,,,, ,,,, ,, ,,, ,,,,,,,,,,, ,,,,篈 ,,,,,,,,,, ,,,, , ,,,,,,,, ,,,,, ,,,,,,,,,,,,,, ,, ,, , ,, ,,,, ,,,,,, , ,,, ,,,,( , ,,,,,,,,,,, ,,,,,(, ,,,,, , ,,,,,,,( ,, ,,,, , ,,,,,( , ,,,,, ,, ,,,, ,, ,,,,, ,, , ,,,,,,, ,,,,,, ,,,,,,,,,瓻,,瓹,,( ,,甈,,( ,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,, ,,, ,,, , ,,,,,,,、,,,、 ,,,, , , , ,,,,,,,,,,珹,,,,,,,,、 ,,, ,,,,,, ,,, , ,,, , ,, ,,,,篈 ,,, ,,, ,,,,, ,,,,,,,,, ,,,,,, ,, ,,,,,(, ,,,,,, , , ,,,, ,,, , , ,,,,,, ,, ,,, , ,,,,甈,,,, ,,,,,, ,, , ,,,,,,,,,,, , , ,,,(,, ,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, , ,,,,,,,, , ,,,,,,, , ,,, ,,,,: ,,,,;,,,,,,,,,籭,,;,, ,,,,,, ,,,,,,,,; 唐氏综合征一般情况 复口(入学博十学位论文?前言 征中,,齙表达,导致通过叶酸合成蛋氨酸途径减少,产生唐氏综合征的一系列 的症状。,,,,蚨ㄎ挥,,,(,,,泶锟赡艿贾掳啄谡稀,,瑾因位于位于 ,,,,,过表达可能损伤,,铣珊托薷础,,,基因定位于,,,,,该基因编 ,,,, , ,,,,,骨髓增生综合征是一种自限性先天性骨髓增生疾病,在唐氏综合征新生 ,,基因位于,,,,,是一种糖解作用里一种重要的酶,过表达的脱基因可 复日人学博十学何论文幸前言 进展,甲胎蛋白,,, ,,,,瑄,,,】、妊娠相 普遍应用于产前筛查,其检出率是,(,,,假阳性率为,,,】。血清中其他的产 本实验拟应用蛋白质组学和代谢组学技术研究孕妇血清中唐氏综合征相关蛋 复口(大学博十学位论文奎前言 白质和代谢物。具体包括以下几个方面: ,,,,蛋白质组学技术分析妊娠,孕妇和证常孕妇蛋白质组特点之间 路和相关蛋白质。 差异性,应用模式识别技术建立小分子代谢物产前筛查模型,为产前筛查提供新 ,,,籔,,,在,胎儿孕妇羊水中的表达均升高。重组人胰岛素样生长因子结 合蛋白(,,,,:,,,,虮日,,ザ,陆盗,,ァ,,,,,对妊娠早期和中 期的,胎儿孕妇血清进行蛋白质组学研究,共发现,个差异蛋白质,包括早期, 在,差异蛋白质中大部分是糖蛋白,,俊,,取, ,,,, ,,,,,,, ,,,技术是美国应用生物系统公司,,,,,,,,, 鉴定出的蛋白质需要进一步生物信息学分析,目的用于分析的工具已经比较 成熟,,,,,,,海,,,,,,,(,,痝,,,应用,,,,,,,,注释的形式分析 大规模的蛋白质组学结果。包括基因功能,参与的生物学过程和细胞定位,以分节 ,,研究对象 ,,试剂 ,, 复口(人学博十学位论文幸第一部分 购,,,,公司,,,昙强谷薎,多抗购于上海鼎国公司。实验中所用水为 ,,,得魇槿コ,G种高丰度蛋白 ,,,, ,,, ,椎鞍住?庖咔虻鞍譍、免疫球蛋白,?デ虻鞍住,(,挂鹊鞍酌浮?L鞍,, 得至,,,,头岫鹊鞍椎娜芤海,玫鞍字世胄呐ㄋ踔,,,,在,,,,,痬,离 ,,,,畉,鞍祝,碦,, ,, ,,(,,蛋白还原、变性和半胱氨酸封闭 ,畉,乖,,,,,, ,,,,,,,,, 室温孵育, ,,(,,蛋白酶解 ,,(,, 分别向,,,,,,,,约列」苤辛,,,艘掖迹,煸取,,,力,,, 至一管中,离心后干燥样品待检。 ,,(,,,,,,,, 阳离子交换色谱柱采用,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,。第 二维反相色谱柱采用,,,,,,瓹,, ,,,,,,, ,,, 系统,,,, ,,,,,,,惺,菘饧焖鳎琍, ,(,,,。 ,,生物信息学分析 ,,,,,,,,数 据库的注释对蛋白质的分子功能,,,,,,,,,,,,?,镅Ч,,,,,,, ,,,,珺,初步分析。 ,,验证 ,琍,,,,,,,,,巍,, 根过氧化物酶,,,,,抗,:,,,,,, ,, ,(,,,,,差异均无统计学意义。 复口(人学博十学位论文?第一部分 ,,血清蛋白质的鉴定 图,瓼,,,,,蛋白多肽的鉴定及相对定量质谱图 复旦人学博十学位论文木第一部分 ,,,,的注释 ,,,,的 以,组和,,楸昙堑谋戎担,,,:,,,,,上调,,,:,,,,,碌, 为显著差异的,共发现,种蛋白。其中,种蛋白在,组上调,,种蛋白下调 ,,,甈,,, ,,, ,,, ,,, , ,, ,,,,,,,,, ,, , ,, , ,, ,, ,,,,, ,, ,,((,,,,,((,,,,,, , ,,,,,,,,, , ,,,, ,,, ,,, ,,, ,,, , 産 , , , ,,, ,,, ,,, ,,, ,,,,,,, , , , ,,,,,, ,,,,,,,,, ,,,, ,,,,產,,(,,,, , ,,,, , , , , , ,, ,,, ,,,,,, ,,,,,,,, ,,,,,((,, ,,,,,,,,, , ,,,, ,,,,, ,,, ,,,, ,,!!!!!!猒,——,,!!!猒,,!猒,,!猒——,,,—,,—一 ,,差异蛋白的生物学过程和功能分类 ,(,ィ荷,锏鹘谡,,,,;代谢过程占,,;刺激应答占,(,ァ,,,。 ,对著异蛋白的生物学过程注释 ,,( ,,, , , ,:, ,,(, ,,,,,, ,,,,,, , ,,(,(,, , ,,,,,, , ,,(, ,,,, , ,(,, , , ,,,,, ,,,, , ,,,,, ,,(, , ,:, , , , ,,,,,, , ,,,,,,,,,,,, ,, , ,,,(, , ,:,,,,,,,,,,,,, , , ,:,,,, ,,,, ,,,, ,,,,,, ,,,一, ,,,,,,,,,,, ,,,,,, ,,,, ,(,, ,,,(, , ,,,,, , ,,,, ,,,,, , ,(,, ,,,(, 复(丑人学博士学位论文幸第一部分 ,,,,, ,(,, ,,,一, ,,,, , , ,,,, , ,,,,,, , ,:, ,,,, ,,, ,,,, , ,,,,,,, ,,,, ,,,(, , ,,,,,, , ,,,, , ,:, ,,,,(, , ,,,(, ,,,, , ,,,,, , ,,,,(,,,, ,:,,,,,,,,, 应用,,,圆钜斓鞍椎墓δ茏?头?郑, ,种差异蛋白的功能分类 ,,甐,, ,,,一, ,,,,““貔龇 ,,,,“““龇“‰ ,,,,,,, , ,,, ,,,,姒渤‰龇缸‰ , ,,, ,,, 。, 。 ,, ,,,,,, ,,,一, ,, , ,,差异蛋白,,的验证 复旦大学博士学位论文幸第一部分 ,合癋翟习 ,,??,,ひ,,,~~~,?一一????一 一( 图,,,鞍自贒,楹螩,组的改变,叩,(, 白。,种蛋白和差异的,种蛋白功能分布均主要是蛋白结合功能、转运功能蛋白、 ,等血清蛋白质分布一致【,’,,,臼笛榛剐路?諸,,,,, ,珹,,是许多受体蛋白的配体,参与脑磷脂 载脂蛋白,,,,,,,, ,,,,,,,,,, 合蛋白,在人的血清、淋巴细胞、脑脊液、羊水、乳汁中都存在。在血清中它是胰 岛素样生长因子,,,,(,, ,,,,琁,(,的主要结合蛋白,是,,,生 物活性的主要调节因子,与,的关系最为密切。人体的生长主要受,,, ,轴的影响, 该轴的主要成分包括,,,和,,,,,,,水平的变化直接影响着,轴的促生 长功能,可参与细胞的生长、分化和存活,并在许多生理和病理情况下发挥作用; ,,,是促进骨骼生长和多种细胞分化及增殖的主要因子。,,,可以提高滋养细胞 的增殖活性,刺激绒毛膜促性腺激素分泌,同时使各型细胞的分裂、分化、增殖、 成熟或存活能力及组织器官对葡萄糖的摄取和氧化及对氨基酸的摄取能力降低,使 细胞分裂周期延长,数量减少,功能障碍,不能有效防止细胞成熟,仃的死亡,可导 致胎儿生长发育迟缓。,,,除通过调控,,,的生物活性影响胎儿及胎盘的生长 发育外,其本身也具有促进细胞分裂的作用,可直接促进胎盘的形成和胎儿的生长 过程,尽,兄衅谘蛩,械腎,,,ǘ瓤捎美丛げ馓ザ,,な芟蕖,,。在许多肿瘤中 作为标记物。 ,琑,,与胚胎发育 有关。妊娠带蛋白,,,,, ,,,,琍,,侵匾5奶堑鞍祝,耸銲,分子 ,,转运蛋白 是在机体中发挥多种重要作用,包括受精和脂代诩,,南妆ǖ繸,在肿瘤恶病质的 ,,酶调节功能蛋白 【,】。在哺乳动物中,纤维连接蛋白的缺乏可导致中胚层、神经管及血管的发育缺陷 , 复口(火学博十学何论文幸第一部分 组,鉴定差异蛋白。根据初步:生物学信息学分析得到很多对生长发育等起重要作 用的蛋白质。但是哪些是和:发病相关的蛋白质,导致:生长发育畸形的重要信 号通路是什么昵,仍需迸一步生物信息学分析,挖掘信息。 复日人学博十学位论文奉第二部分 第二部分构建差异蛋白相互作用网络 ,,,,,,,,,,提供了 ,,,,,,, 复口(人学博十学位论文幸第二部分 ,, 差异蛋白的家族聚类分析 ,,差异蛋白的相互作用网络分析 析数据导入,,,玫椒治鼋峁,訧,保存。 差异蛋白与经典血清学标记物分子作用网络分析 利用,,版本,,,砑,,,霾钜斓鞍子刖,涞难G逖П昙俏,,,,,、 差异蛋白的功能聚类分析 ,, ,,,,木劾喙,,啵,,,。分类主要是脂质运输、酶调节功能、细胞分化发育、 , 复口人学博斗,学位论文拳第二部分 复口(人学博十学位论文宰第二部分 复旦大学博士学位论文幸第二部分 雪当当 矗 ,,差异蛋白相互作用网络分析 白。 表,种主要聚类中的蛋白分子相互作,,簀网络 ,,,,, ,,,,,, ,,,,,,, ,,, ,,,,, , ,,, ,,,,,,,,,,,,, ,,, ,,,,,,, ,,, , , , , ? , , ? , , , 三掣砂““””小”””乜 — ,, ” ” ” ” ” ,,差异蛋白与经典血清学标记物分子相互作用网络分析 ,,,,, , , ,,,, ,,, , ,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,, , 复旦人学博士学位论文幸第二部分 ,,,茴 臗 , , , 埽躨 ( , 怀一 (,唧 ? 参与脂代谢、心血管系统发育、神经系统发育三大分子相互作用网络,其中参与心 畸形和心血管畸形可能和,,,酚泄兀,臼笛槔,胕,,蛋白分离技术联合高效 ,, , 信号传递途径起着极为重要的作用,控制着细胞多种生理过程。细胞外信号调节激 ,,,,,,是,,家族的一员,它的信号传递 心脏是另一主要累及的脏器,,中先天性心脏病患病比率高达,,。一个对 唐氏综合症新生儿的随机研究发现,,,的这类患儿经超声心动图检查发现有先天性 心脏病,最常见的病损为心内膜挚缺损,贾滦姆亢托氖蚁嗤,、房间隔缺损和室 间隔缺损,法洛氏四联症和孤立动脉导管未闭。先天性心脏病最严重的类型是肺血 管阻塞,这一并发症能导致充血性心力衰竭。唐氏综合征患儿这一潜在的致命并发 病中发挥保护作用【,恰,ザ,贓,通路的改变可能是,心脏受累的病理生理机制。 可能用于产前筛查的蛋白质 本实验发现,,位于脂代谢网络重要交通,在心脏和神经系统发育网路中占 复口(大学博十学位论文幸第二部分 重要位置。,,,基因型与阿尔茨海默病发病相关,有报道,患者的母亲,,, ,,,基因型在,患儿孕妇和,鲁,懈静?薏钜臁,,,同时,,综合既往文献报道 的血管紧张素,,,,,,, 心血管功能调节、水盐平衡调节中起重要作用。其在调节子宫胎盘血管阻力和血流 复口(人学博十学何论文幸第二部分 同源,同属于血清类白蛋白家族。,,茉谖,,谽下协调提高凋亡应激下皮层神 复口(人学博十学位论文枣第二部分 第三部分应用代谢组学建立唐氏综合征产前 床疾病诊断中应用广泛,,,,萚,】应用,(,,,和,,,,,,,,,,,方法 复口(人学博十学位论文幸第二部分 合指标,饕3煞,上,从而利用主要成分提取数据集的特征。它把给定的一组相 关变量通过线性变换转成另一组不相关的变量,这些新的变量按照方差依次递减的 顺序排列。在变换中保持变量的总方差不变,使第一变量具有最大的方差,称 为第一主成分,第二变量的方差次大,并且和第一变量不相关,称为第二主成分。 依次类推,,霰淞烤陀,个主成分。 法,,(,,,,,, 功能,操作简单。在经济、科研和教育中获得广泛应用。 支持向量机,,,, ,,, 在这个空间里建立有一个最大间隔超平面。在分开数据的超平面的两边建有两个互 习。在解决小样本、非线性及高维模式识别问题中表现出许多特有的优势,并能 ,,研究对象 参照羊水穿刺染色体检测,或新生,夕,周血染色体检测确诊。 ,,试剂和仪器 乙腈,,,高效液相色谱纯,喊譓,,公司,甲酸,,状,购自美 国,,,公司,所用水为,,,甉去离子水,,,,,。色谱仪器,,,, , ,,,,。,,,狿 , ,,实验方法 血清过滤。 ,赫,,ィ珺液占,ァ,诔,孪路胖霉,梗,缮现势准觳猓,?,嗦艘海,,,冰 箱保存。 ,,(,, 是一种降维处理技术。 数掘预处理:,组,,攵哉兆楦,,,珹,,,自带软件提取数据,峰匹配去 ,软件分析,设置观察 ,点击下一步分析。 将上述数据用,,瓺,喑獭,紫冉,,葑霰曜蓟,,怼,经标准化处理后的数 ,荅,牡谝桓龀煞郑瑃,,,,,是,的第一个轴,它是一个 ,荈,牡谝桓龀煞郑琔,,,,,是,的第,个轴, 单位向量,即, 并且,, ,,。 建立公式: 即,掌,, 将上述,,,,鍪,荼曜蓟,螅,,蠸,分析。 ,,一般情况 能更好的区分。 , ? , ,’一??一 (一, 伯 , ? ,,平面图,除,外二者分别聚类在不同的区域 ,,,】,(,,, 图,(,组和,,镻,三维图,除,外,二者分别聚类在不同的区域 , 复旦人学博士学位论文串第三部分 嘶 ? 姗 姗 ?? ? 图,(,,,所建立模型,二者分别聚类在不同的区域。 性率为,,,。,,,呙婊,,(,,如表,,,。模型公式为 ,(,,。参与预测的离子为,,(,,,,,、,,(,,,,,、,,(,,,,,,,,、 ,预测模型 超声和孕早期血清学检查,,(,,,,(,联合方法,唐氏综合征检出率可 达,,,一,,,但假阳性率为,ァ,,,,踟】,亦存在检出率越高伴随假阳性率越 高问题,G罂刂圃,,以下,,,昀刺岢隽苏,迳覆榉桨讣戳讲街枭覆榉桨,妊 娠早期,焉镏衅,。妊娠早期,,,,,周,,,,(,腿焉镏衅,,(,(,, 谢组学对疾病诊断的有效性,确立了代谢组学方法在疾病诊断中的重要价值。 多基因的过表达所引起的广泛效应是,的主要病因,在胎儿发育阶段可能出 现,号染色体基因过表达所导致的病理生理改变,,患儿孕妇血清中大量蛋白质 的差异可能导致下游小分子代谢物改变。强大的理论依据作为本实验坚强后盾, ,,治鼋獶,,,,,榛,揪劾嘤诓煌,那,颍琍,(,将两组完全分开,并 复口(人学博十学何论文事第二部分 参与脂代谢、心血管系统发育、神经系统发育三大分子相互作用网络,其中参与心 ,,τ么,蛔檠Ц,菅G宕,黄捉,?绿剖献酆险鞑,詉『诊断模型,灵敏度为 物,仍需进一步二级质谱鉴定。 ,,唤鲅橹ち松窬,低澈托难9芟低秤隕,通路的关系,而且首次在妊娠期胚 特征谱,并建立了唐氏综合征产前筛查新方法。 参考文献 ,,,,(,,,, ,,,,,, , ,】( , ,,,,,,, ,,,, ,,, ,,, , ,,,,,,, ,, ,, , ,, ,,, ,,, , ,,,,,,, , , , ,, ,,,,,,瓵,,,,,,,,,,,,,( ,,,, ,琌,,,,,,,,, , ,,,,(,,,, ,,,,(,,,, ,,,,, ,,,,, ,,, ,】( ,(,, ,,,,,,, , ,,,,,,,,,: ,,,,瓾, ,,,,( ,】( ,,,,,,,, ,,,,,,, ,(,,,,,,, ,,,,,,,,:,,,,( ,,,,,甆,,,, ,,,,,, ,】( ,,,,,,, ,,,,:,,,,,, ,( ,畂, ,,,,, ,,,,,, ,琂,,,(,,,,,, ,,( ,,,,,(, ,,,,, ,,,,,瓺,,, ,,,, ,, , ,,,, ,,,,, ,,,,,,,,,, ,,,瓵,,,,,,, ,,,,甁 ,, , ,,,,, ,,, ,,, ,,,,( ,, , ,,( ,琇,, ,,, ,, ,,, ,現,,, ,,,,,,疭 ,,,,(,,,, ,,,,, ,,, , , ,,,( ,:, ,,,,,,,,, ,,( , ,(,,,,, ,,,,,, ,,,,,甁,,,,,,,,,,,:,,,,( ,, ,,, ,,,,, ,,,,,,, , ,,,,, ,,,,琓,,,, ,珻,,,, ,,,,甀,,,, ,猵,,,,,,,,,:, ,,,,瓸,,,,,,,,,,,,,,,,( ,,,,, ,,, ,,,,,(,,, ,,,,( ,,,,,,(,,,,,,,,( ,,,,(, ,,, ,,,,,,,,,, ,,,,(, ,,,,,: ,,,,( ,,,,, ,,, , ,,,,,, , ,,,,,,,,(,,(,,,,,,,,,( 复口(人学博十学何论文幸参考文献 ,,,,,,, ,,, ,,,,(,,,,,,, ,,(,,,,,,,,,, , ,,,,,,,,,,,, ,(,, ,,, ,琒,,, ,,,,,,(,,, ,,,:,,,,( ,,,,,,,琒,,, ,,,, ,,, ,,, , ,,,,( ,,,,,,,,:, ,,,,(,,,,,:,,,, ,,, ,,(,,,,琖,,, ,產, ,, ,(,,,,,,,,,,,, ,,,,(,,,,,,,,,,,( ,,:,,,,( ,,,, ,,(,, ,,?鷊, ,,,,, ,,,,,(,, ,, ,,,,,,, , ,,,,,, ,琒, ,,( ,,,,, ,,,(,,,,,, , ,: ,,,,,,,,, ,,,,, ,,,,:,,,,,,, ,,, ,,( ,( , ,,, , ,, ,,,,,,, ,( ,(,,,, ,,,,, ,,,, ,,,甅,,,,,,,,,,,( , , ,, , ,,, ,,, ,,,,,,瑄,, ,,, ,, ,,,,,,(,,,,,,,,,( ,,,,,,,,( , ,,, ,,, ,(,,,,, , ,,,,珼,,琧,,,,,,,瑄,, ,,,,,, ,,,, ,,,,, ,,,( ,珺,,, ,琇, ,, ,,,, ,,( ,, ,,,,, , ,,, ,琓,,,, ,,,,,, ,,,,,,, , ,,,,,,, , ,,,, ,,,,,,,,,:, ,,,(,,, , ,珺,,,,, ,(, ,,(,,,, , ,,,,,,, ,,,,, ,,,,,,,,,(,,,,,,, ,,(,,, ,, ,,,,(,,,, ,, ,,,,,,, , ,,,( ,,,,,,, ,,,,, ,,,,,,,, ,,, ,,, ,(,,,, , ,,,, , ,,, ,,,, ,,( ,,, 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测定病理生理蒯激或基因改变情况下生物系统的 样品进行快速分类,绫砹训目焖偌,,。 胞孛物缀织中蕞因大约为,,数量级,即使在最小 的细菌基因纽中也有几千个基因,,蚕鞠级中代谢物 相整不大。所以研究中采用的技术更通用。 代谢组掌的研究方法 成分系统浏篓分析(研究整个机体的系统代谢图谱 代谢组学是对体液(细胞、器官等样品运用质 , 复口(人学博十学位论文宰综述 斩,预处理筒单,通过氯原子谱峰宦观显示样晶中组 一、样品的制备和数据的采集 代谢组擘研究中常用的监测技术(一般不需要 对样本进行特别的分离、纯化等。但是在离体条件 下,缎脆和组织的代谢状态迅速可变,代谢物的质 分的功能基团和商极性键的振动,而特定的化学结 构有特定的吸收频率,通过测定实验样品的红外吸 收频率和强度。可以辨别出各个成分。,,具有扫 描速度快,该肽谑迪,、不需要试荆、无损伤性、商 分析和鉴定(郎数据的采集(这是代谢组学研究中 关键的步骤。根据样品特性,实验目的和各代谢物 化学物理参数选用不同的分析鉴定技术。目前最常 于不可区分异构物,且组分片段和一些络合离子也 用的分离分析手段包括,—,联用、液相色谱和质 对其有影响(由于离予抑制不能进行定鳖分析。 二、数据的分析,解释 进行处理和分析。首先对原始谱图的数据进行提取、 峰对齐(去噪等处理,然后通过模式识别和多纬统计 分析等方法对数据分析(获取有用的信息。常用的方 法有非监督方法和有监督方法。 提供较高分辨率和检测灵敏度。并且有可供参考、 ,,羌喽椒椒,,,,,,, 比较的标准谱图库,易褥到待分析代谢组分的定性 结果。缺点是,(,联用需要对样品进行衍生化 处理,因此无法分析膜脂等热不稳定性的物质和分 ,,,,,,,,,,,,、非线性映射 子质璧较大的代谢产物。近年来。采用气相色谱和 ,,,,, 种高纬数据降纬的方法,将分散在一组变蟹的信息 集中到某几个综合指标,饕3煞,上,从而利用主 要成分提取数据集的特征。 ,,屑喽椒椒,,,,,, , ,,,, ,,,、偏最小:乘法,,,, 馏最小二乘法判别分析法,,,,,,,, ,,,,(,(,,,?斯ど窬,,,,,,,, ,,, 用予代谢组学中,其分离样品效率高子普通的色谱 质谱联用,耗时短,往往, 代谢组学在瞄床中的应用 的分析过程。 , 复口(人学博十学何论文?综述 国 外医学妇产辩肇分册,,年,淼,嬲 究主要焦点已由测序转向功能研究,转录组学、蛋 三、治疗监测 在治疗过程中,药物在体内的吸收、分布、代谢、 排泄过程或某一治疗措麓会使机体的功能活动发生 变化,这些变化可能表现在基因和,或蛋白质水平, 进而影响终端代谢产物的变化,也可能与这些生物 大分子活动无明显关联,健仍然会在代谢物层次上 有反应。因此,代谢物水平的变化是治疗监测的有效 一族病诊断 疾病导致机体病理生理过程变化最终引起代 指标。事实上(代谢组学技术已经应用于治疗滥测, 例如,应用代谢组学方法监测抗逆转录酶病毒疗法 ,,,,,,, 将提供一种较好的疾病诊断方法。,,,萴位用 良反应抽;。 代谢钮学虽然是,,新兴科学。毽其发展迅速, 研究方法翻技术也越来越完善,应用领域越来越广。 ,,。并且成功诊断出,齦期卵巢癌愿者。代谢组 代谢组学是系统生物学不可缺少的一部分,随着研 脑脊液成分分析,提供了一种优于传统实验室的快 速诊断和鉴别脑膜炎瘸原学的方法。另外,代谢组 , , , 叫, ,岫铲(,,,玎即,,嚎А,稩,鹝,聅【,(蹦 , ,,,,,,,,,, ,(,,,儿,,, (,,絭, , , , , 痑, , , , , ,奚箁,诅【,(,((,,,,,,(研,,,,,, 【,,,,(,甅,,,,,,畉, ,,甧,萨,,,,?,,,,,, , 棚钟 , , ,锄五髂,:(,翨,,,, , (, , 挫, 瓸, , 狹, 甦, ,,緊,,?,,,,咖 节机制和关键调节点(联合摹因组学,转录组学和 , , 轎 , , , , , 蛋白质组学阐明疾病的发瘸机制。例如。通过对禽 , 籥印 :( , 血压息者斑清代谢物轮廓分析等认为代谢物轮廓 ,】,,,,,儒赗,,,(埘, ,鏽,,,,,,,,,帅甥,衖,麟耫蛐粕糖,鷐,,(,( 与血压水平、血清脂蛋白成分存在一定关系,收缩 ,,,鑓,甖,,,:‰,,::,,,,( ,】 ,疕,鰊 压,, , 矗, 觙, , , 甿, , , ,省ど搿發,鷗 复口(大学博十学位论文宰综述 国 外 学 妇 产 辞 钟 , , , ’ , ,, ,,篊,, , ,,,?幽?,,,, , , , , ,,,,奚綢曲,,眒 , , , , ,瓹 ,尽辭,(,,,,,, 【, : , (( , , , , , , , 【,:甄蛳,,瓸,,, ( , ,( , , ,仡群,,坯, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , (, ,( ,膖, ,辤,,断,,,印:,浚甌, , , :, , ,( , , ( , , , , , , , ,,戚,(,,,,給,,,, ,,, ,(嘲,?,,,,佃,,,,枵鷄 , , ,,,,,,,:,,,,( 璶, , , , , 疊 , , , , , , 睼 ,,,,緁, ,,,,, , , , , , , ( , ( , , , , ,,, ,,(,,(,,,,,, , ,,, ,,,,,,, , ,,,,, ,,,ぁ,?,,,,,, ,,,,,,,,,, ,,,,,,, ,,, ,,,,, , ,,,, ,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,!狧,, , , , ,,,,, ,,,,,,,,,, ,,,,,,,』,, ,,, , , ,,,, ,,,,,,, ,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,, ,,,,, ,,, ,,,,,,猼,,, , ,,,, ,,,ぁ,—?,,,,,,,, ,,,,,,猼,,, , , , ,,,,,,,,, , , , ,,,,, ,,, , ,,,,,,,,,, , ,,,,,,,,,, ,,,,, ,,,,,,,,,, ,,, ,,, ,,,,,,,,,, , ,猙,,, , ,,, , , ,,,,,,,,,, ,,,,,,, , , ,,, ,,,,,, ,,,,,,, ,,,,,,, ,,, ,, ,,,, ,,, ,,,,, ,,,,,,,, ,,,,,,, ,, , , ,,,,,, ,,,,, ,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,, , ,,,,,,,,,, ,,,,,,, ,,, , ,,,,, , ,, , , ,,, ,,,,, ,,,,, ,,,, ,,,,,,,,,, , , , ,,,, ,,,,,,,,,, , , ,,,,,,, , ,,?,,,,,,, ,,,,,,猼,,, ,,,,,,,,,,, , ,,,,,,, , ,,,,, ,,, , ,,,,, , ,,,,, ,,, , , , , , ,, ,,,,, ,,, ,,,,,,,, , ,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,, , , ,,, ,,,,,,, , ,, ,,, , ,,,,, ,,,,,,,,,, ,,,,,, ,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,, ,,, ,,,,, , , ,,,,,,, ,,,,, ,,, ,,,,,,, , ,,熔形繩垦堕,,?, ,,,琘, , ,,,, ,,,,,,( 感谢在百忙之中抽出时间审阅本论文的专家教授。 最后,尤其要感谢我的爱人赵雷。感谢他三年来的同甘共苦、携手并进,感 谢他的呵护和包容,在我情绪低落的时候,更感谢他的鼓励、支持和信任,使我 回馈这份恩情是我人生最大的幸福和心愿。 新的人生征途又要开始了,今后唯有不断努力,才不致辜负所有关心我的人的期
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